More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0833 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  93.62 
 
 		 94 aa  176  7e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  92.55 
 
 		 95 aa  175  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  91.49 
 
 		 95 aa  173  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  90.43 
 
 		 95 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  88.3 
 
 		 95 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  89.36 
 
 		 95 aa  168  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 100 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  63.04 
 
 		 94 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  65.96 
 
 		 92 aa  122  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 103 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  58.7 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 98 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 98 aa  117  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 98 aa  117  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 104 aa  117  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 104 aa  116  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 91 aa  116  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 		 94 aa  116  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  61.05 
 
 		 97 aa  115  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  57.45 
 
 		 98 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 		 98 aa  115  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  115  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  61.54 
 
 		 94 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 100 aa  114  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 94 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 94 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 		 104 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 98 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 104 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 98 aa  113  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 98 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 		 104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  58.06 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  58.06 
 
 		 98 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 94 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>