More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00675 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  100 
 
 
91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  84.62 
 
 
91 aa  159  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  76.4 
 
 
92 aa  141  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  71.91 
 
 
92 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  70.79 
 
 
93 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  68.54 
 
 
92 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  65.93 
 
 
98 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  64.04 
 
 
89 aa  125  3e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  64.04 
 
 
98 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
94 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
96 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0244  chaperonin Cpn10  63.27 
 
 
96 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329801  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
96 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
100 aa  111  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
95 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  110  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  110  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 
97 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  53.12 
 
 
97 aa  104  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  104  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  54.17 
 
 
97 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
94 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
94 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
95 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
101 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 
98 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  55.91 
 
 
96 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
102 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
104 aa  102  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 
100 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 
100 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 
95 aa  102  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
96 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 
97 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 
100 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 
94 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
96 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
96 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
96 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
96 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
103 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  55.32 
 
 
95 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 
98 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  55.91 
 
 
103 aa  100  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
101 aa  100  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 
100 aa  100  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
97 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
96 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
98 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 
96 aa  100  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 
97 aa  100  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
103 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
103 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
98 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
103 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  52.08 
 
 
127 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  52.08 
 
 
127 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  52.08 
 
 
127 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
96 aa  100  9e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 
102 aa  100  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
104 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  54.26 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
98 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 
98 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
94 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
95 aa  99.4  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
95 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 
102 aa  99.4  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 
104 aa  99.4  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
96 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  50 
 
 
95 aa  99.4  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 
98 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
97 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  52.69 
 
 
103 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  52.08 
 
 
98 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
98 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  50.53 
 
 
98 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>