More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1547 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 95 aa  187  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  82.98 
 
 		 95 aa  159  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  80 
 
 		 95 aa  157  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 		 95 aa  153  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 		 96 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 94 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 95 aa  127  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 104 aa  123  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 94 aa  123  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  63.04 
 
 		 98 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  123  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  61.05 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 104 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 94 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  120  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  120  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 		 98 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 95 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 		 95 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 95 aa  120  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 95 aa  120  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 		 98 aa  120  9e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6590  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.870394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 104 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 104 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  62.64 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  62.77 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 97 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>