More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1844 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  100 
 
 
91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  84.62 
 
 
91 aa  159  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  82.02 
 
 
92 aa  150  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  74.16 
 
 
93 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  70.79 
 
 
89 aa  136  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  71.91 
 
 
92 aa  135  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  71.43 
 
 
98 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  71.91 
 
 
92 aa  133  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  69.66 
 
 
98 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
95 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0244  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
96 aa  120  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329801  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
96 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 
94 aa  117  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 
100 aa  117  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 
95 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 
95 aa  116  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
95 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 
95 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 
94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  61.96 
 
 
94 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  56.38 
 
 
95 aa  110  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 
95 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  60.87 
 
 
94 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  56.38 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
96 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
98 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
98 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
94 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  58.51 
 
 
96 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
98 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
104 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
95 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 
98 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  52.69 
 
 
98 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 
100 aa  106  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  105  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
98 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
98 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  53.12 
 
 
97 aa  105  2e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 
104 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 
95 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
95 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
121 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
104 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 
96 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  59.14 
 
 
101 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 
99 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
96 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
105 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
104 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
104 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
96 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 
95 aa  105  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  54.26 
 
 
96 aa  104  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
95 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
95 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  53.76 
 
 
98 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
100 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
96 aa  104  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
95 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 
95 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
104 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
96 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 
98 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
96 aa  103  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
96 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
97 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  51.61 
 
 
98 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
105 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
96 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 
96 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  53.12 
 
 
97 aa  103  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
105 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 
97 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>