More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0244 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0244  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 96 aa  187  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.329801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 91 aa  120  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  71.88 
 
 		 92 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  63.27 
 
 		 91 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  63.64 
 
 		 98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 		 98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1827  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 92 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0862396 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  59.18 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  58.76 
 
 		 94 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0541  co-chaperonin GroES  59.79 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160733  normal  0.58747 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  56.7 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1937  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000542677  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  55.67 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  54.17 
 
 		 100 aa  98.2  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  53.61 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  52.08 
 
 		 94 aa  94  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  48.45 
 
 		 96 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  51 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  49.48 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  51.04 
 
 		 94 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  51.02 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  47.96 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  49.47 
 
 		 94 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 		 105 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 		 105 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 94 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  49.48 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  46.46 
 
 		 106 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  50.52 
 
 		 98 aa  89.4  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  50.52 
 
 		 96 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  50.52 
 
 		 96 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  46.39 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  48.45 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  51.02 
 
 		 97 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  49 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  51.55 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  48.48 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  47.42 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  49.48 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  45.45 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0183  chaperonin Cpn10  48.45 
 
 		 96 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  45.45 
 
 		 103 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  49.48 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  55.68 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  49.48 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2599  10 kD chaperone  51.04 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 96 aa  87.8  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  48.45 
 
 		 98 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  48.45 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  48.45 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  49.48 
 
 		 94 aa  87.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  50.52 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  49 
 
 		 97 aa  87  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  48.98 
 
 		 98 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  50 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  50.53 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  51.02 
 
 		 121 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 101 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  47.42 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  48.45 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  49.48 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  45.36 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  51.55 
 
 		 104 aa  85.9  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  44.33 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  48.45 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  49.48 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2821  chaperonin Cpn10  48.96 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0107479  normal  0.438388 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  47.42 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  44.33 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  52.17 
 
 		 94 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  47.42 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  46.94 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  52.87 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  46.39 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>