More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1419 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  100 
 
 
96 aa  186  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  83.33 
 
 
96 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  76.04 
 
 
105 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  75.79 
 
 
105 aa  153  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  82.11 
 
 
96 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  75 
 
 
105 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  75 
 
 
105 aa  151  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  75 
 
 
105 aa  151  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  75 
 
 
105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  75 
 
 
105 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  73.68 
 
 
105 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  78.95 
 
 
96 aa  150  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  78.95 
 
 
96 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  72.63 
 
 
105 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  72.63 
 
 
105 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  80.21 
 
 
96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 
96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  77.08 
 
 
96 aa  144  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  66.67 
 
 
105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  66.67 
 
 
105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  66.67 
 
 
105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  73.68 
 
 
96 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 
96 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  71.88 
 
 
96 aa  142  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  77.08 
 
 
97 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  77.08 
 
 
97 aa  140  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  72.92 
 
 
96 aa  140  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  76.04 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 
96 aa  140  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 
96 aa  140  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  63.54 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  63.54 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  63.54 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 
96 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  63.54 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
95 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 
96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
127 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  138  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 
96 aa  137  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 
96 aa  137  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  75 
 
 
97 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  68.75 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 
96 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 
95 aa  137  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
96 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  72.63 
 
 
96 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
96 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
96 aa  137  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 
96 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  75.53 
 
 
96 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 
96 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 
96 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 
96 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  70.53 
 
 
96 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  67.37 
 
 
96 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  75.53 
 
 
96 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  71.58 
 
 
96 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  65.98 
 
 
97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 
96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
95 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  63.54 
 
 
96 aa  131  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 
96 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  65.62 
 
 
96 aa  131  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
97 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
97 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
97 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
96 aa  130  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 
96 aa  130  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
95 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  64.95 
 
 
97 aa  130  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 
95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 
97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1568  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 
96 aa  127  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0136  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 
96 aa  127  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0500096  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 
97 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  63.54 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 
96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 
95 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 
97 aa  127  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>