More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0639 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 96 aa  187  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  91.67 
 
 		 96 aa  178  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  91.67 
 
 		 96 aa  178  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  76.84 
 
 		 95 aa  150  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  70.83 
 
 		 96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  140  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  140  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  69.07 
 
 		 97 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  68.04 
 
 		 97 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  68.04 
 
 		 97 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  68.04 
 
 		 97 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  67.01 
 
 		 97 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  67.01 
 
 		 97 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  63.54 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 105 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4502  co-chaperonin GroES  68.04 
 
 		 97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125331  hitchhiker  0.00150559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  133  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 104 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 104 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  131  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  64.13 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 127 aa  131  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 104 aa  131  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  58.33 
 
 		 105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  58.33 
 
 		 105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  58.33 
 
 		 105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 105 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 105 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 105 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 105 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  61.05 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  61.05 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 97 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  62.77 
 
 		 95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  62.5 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  61.29 
 
 		 98 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 104 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>