More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4502 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4502  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 97 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125331  hitchhiker  0.00150559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  88.66 
 
 		 97 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  88.66 
 
 		 97 aa  170  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  88.66 
 
 		 97 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  87.63 
 
 		 97 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  86.6 
 
 		 97 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  86.6 
 
 		 97 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  88.54 
 
 		 97 aa  167  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  83.33 
 
 		 97 aa  162  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 		 97 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  82.29 
 
 		 97 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  70.83 
 
 		 95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  64.58 
 
 		 96 aa  134  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  68.04 
 
 		 96 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  68.04 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  68.04 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  63.92 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  63.92 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  64.95 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  64.95 
 
 		 96 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  62.5 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  63.92 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03919  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  120  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  61.46 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0843  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  59.38 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0956  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377346  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3752  co-chaperonin GroES  57.29 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.872968  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2494  chaperonin Cpn10, GroES, small subunit of GroESL  59.38 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0174114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 97 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  59.38 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  57.73 
 
 		 104 aa  117  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  55.21 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  55.21 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  55.21 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  57.29 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  57.29 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0592  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  57.73 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3530  co-chaperonin GroES  59.38 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.437614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00143  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  58.95 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002224  heat shock protein 60 family co-chaperone GroES  58.33 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3404  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 		 105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  57.29 
 
 		 104 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2238  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>