More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3082 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 105 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 105 aa  207  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  90.48 
 
 		 105 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  89.52 
 
 		 105 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  89.52 
 
 		 105 aa  184  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  86.67 
 
 		 105 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  85.71 
 
 		 105 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  85.71 
 
 		 105 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  85.71 
 
 		 105 aa  179  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  84.76 
 
 		 105 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  80 
 
 		 105 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  80 
 
 		 105 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  80 
 
 		 105 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1205  chaperonin, 10 kDa  77.14 
 
 		 105 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2431  chaperonin, 10 kDa  77.14 
 
 		 105 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.564469  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0344  chaperonin, 10 kDa  77.14 
 
 		 105 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272822  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2616  chaperonin, 10 kDa  77.14 
 
 		 105 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  75 
 
 		 96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 		 96 aa  150  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  73.68 
 
 		 96 aa  143  9e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 95 aa  142  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 96 aa  140  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 96 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 96 aa  139  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 127 aa  137  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  70.53 
 
 		 96 aa  137  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 97 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  136  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 97 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  67.01 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  135  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 97 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  67.71 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3816  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0863  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000337259  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0737  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.060744  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0645  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0733336  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  134  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_008060  Bcen_0377  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00305942  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0859  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00336057  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0830  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000337917  decreased coverage  0.00000232712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  133  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  133  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1568  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 96 aa  133  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5272  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3452  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2615  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1939  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0534  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0136  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0500096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  131  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3523  co-chaperonin GroES  68.42 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0578  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0946  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0150753  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3996  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0806135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  130  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  61.05 
 
 		 96 aa  130  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  130  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2566  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000246528  normal  0.0576287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2036  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.283417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5660  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00582828  hitchhiker  0.00523053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  59.38 
 
 		 96 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  58.1 
 
 		 105 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  60.42 
 
 		 97 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  61.05 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  61.05 
 
 		 95 aa  123  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>