More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2523 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2523  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 104 aa  206  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  56.52 
 
 		 94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 		 96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 98 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  57.61 
 
 		 95 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  56.38 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 95 aa  110  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3373  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  58.7 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 98 aa  110  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  54.35 
 
 		 98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 97 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  51.58 
 
 		 97 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  55.32 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  53.68 
 
 		 101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 		 94 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  54.74 
 
 		 101 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 94 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 97 aa  106  8.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  53.68 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  54.95 
 
 		 103 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  52.17 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 		 102 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 97 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  54.35 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  52.13 
 
 		 97 aa  104  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  53.19 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 102 aa  104  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  50 
 
 		 98 aa  104  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 98 aa  103  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  55.43 
 
 		 94 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  54.44 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 98 aa  103  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  53.19 
 
 		 106 aa  103  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 100 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  52.13 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  52.13 
 
 		 97 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 96 aa  103  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  49.46 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  51.06 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 95 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 97 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  52.75 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  47.87 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0286  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000313463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1909  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.815751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1076  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 98 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.12184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  51.65 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 96 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  50.49 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  52.22 
 
 		 103 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  49.47 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  52.75 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  47.87 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  47.87 
 
 		 105 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  47.47 
 
 		 101 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  48.94 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  47.87 
 
 		 94 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  50 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  48.94 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>