More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2314 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2314  co-chaperonin GroES  100 
 
 
103 aa  202  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5138  co-chaperonin GroES  89.32 
 
 
103 aa  184  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05031  hypothetical protein  88.24 
 
 
166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2170  co-chaperonin GroES  88.24 
 
 
103 aa  181  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0969  co-chaperonin GroES  86.27 
 
 
103 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18371  co-chaperonin GroES  86.27 
 
 
103 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15561  co-chaperonin GroES  87.25 
 
 
103 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0505  co-chaperonin GroES  87.25 
 
 
103 aa  178  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.31516  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  83.5 
 
 
103 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3241  co-chaperonin GroES  84.31 
 
 
103 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.257157  normal  0.413821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2855  co-chaperonin GroES  84.31 
 
 
103 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16271  co-chaperonin GroES  82.52 
 
 
103 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0145  co-chaperonin GroES  79.41 
 
 
103 aa  174  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1530  co-chaperonin GroES  83.33 
 
 
103 aa  173  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2885  chaperonin cpn10  83.5 
 
 
103 aa  173  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.478438  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16391  co-chaperonin GroES  81.55 
 
 
103 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  83.33 
 
 
103 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  81.37 
 
 
103 aa  171  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  82.52 
 
 
103 aa  170  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  63.44 
 
 
95 aa  123  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  61.96 
 
 
95 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  58.89 
 
 
94 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  56.99 
 
 
95 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0234  chaperonin GroS  54.84 
 
 
97 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  55.56 
 
 
104 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  54.84 
 
 
97 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  58.06 
 
 
94 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  61.29 
 
 
96 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  58.89 
 
 
94 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  59.14 
 
 
94 aa  111  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  57.14 
 
 
94 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  55.67 
 
 
98 aa  110  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  55.1 
 
 
98 aa  111  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 
94 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 
96 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 
96 aa  110  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  57.14 
 
 
96 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1231  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2523  chaperonin Cpn10  53.76 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  57.61 
 
 
95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  61.11 
 
 
94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  52.69 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  57.78 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4026  Chaperonin Cpn10  53.68 
 
 
103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  51.11 
 
 
104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  56.04 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  52.58 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  56.67 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  50.54 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  57.78 
 
 
94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  53.33 
 
 
104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  55.43 
 
 
98 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  56.04 
 
 
96 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  52.69 
 
 
97 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  54.84 
 
 
94 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  58.24 
 
 
121 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  51.06 
 
 
97 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  52.04 
 
 
98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  54.95 
 
 
95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  50 
 
 
104 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  55.21 
 
 
96 aa  107  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
95 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  57.78 
 
 
104 aa  107  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  56.04 
 
 
96 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  53.76 
 
 
103 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  53.12 
 
 
98 aa  107  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  48.98 
 
 
98 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  56.04 
 
 
96 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  54.95 
 
 
96 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  53.26 
 
 
102 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  54.44 
 
 
94 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  46.24 
 
 
104 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  55.32 
 
 
95 aa  106  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  54.44 
 
 
102 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
95 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  54.26 
 
 
95 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  55.91 
 
 
95 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  53.61 
 
 
98 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07560  Co-chaperonin GroES  47.92 
 
 
98 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371401  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  56.52 
 
 
95 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  53.19 
 
 
95 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  55.56 
 
 
96 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  51.55 
 
 
97 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  54.35 
 
 
98 aa  105  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  54.95 
 
 
95 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  50.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  52.08 
 
 
98 aa  105  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  52.58 
 
 
97 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  52.04 
 
 
98 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  56.99 
 
 
95 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>