85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1017 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1017  transposase  100 
 
 
77 aa  157  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3700  transposase  79.35 
 
 
134 aa  141  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00073433  normal  0.118807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1655  transposase  74.19 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2592  transposase  72.04 
 
 
134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.319874  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3048  transposase  75 
 
 
84 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00273884  normal  0.555878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2883  transposase  82.69 
 
 
105 aa  88.6  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.467748  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3756  transposase  89.13 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.807636  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2695  transposase  89.13 
 
 
93 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.185227  normal  0.153433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3240  transposase  63.33 
 
 
64 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.408915  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3239  transposase  87.1 
 
 
69 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.283293  normal  0.111466 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1291  transposase IS200-family protein  35.29 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.254589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1416  transposase IS200-family protein  35.29 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0553663  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1050  ISCpe2, transposase orfA  37.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00601796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0722  ISCpe2, transposase orfA  37.33 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1566  ISCpe2, transposase orfA  37.33 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.414707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1584  ISCpe2, transposase orfA  37.33 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00754423  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0546  ISCpe2, transposase orfA  37.33 
 
 
187 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0471  ISCpe2, transposase orfA  52.27 
 
 
123 aa  47  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2706  transposase IS200-family protein  35.23 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000307222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0678  ISCpe2, transposase orfA  52.27 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0406  ISCpe2, transposase orfA  52.27 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0625  ISCpe2, transposase orfA  52.27 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274622  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1279  transposase IS200-family protein  33.33 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2405  transposase IS200-family protein  31.76 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.585077  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2480  transposase IS200-family protein  29.63 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0900  transposase IS200-family protein  32.18 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  hitchhiker  0.000000040473 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3803  transposase IS200-family protein  32.18 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4188  transposase IS200-family protein  28.4 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4295  transposase IS200-family protein  28.74 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000924983  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1500  transposase IS200  32.1 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0189  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2038  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2179  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.258783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2847  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3001  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000296892  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1391  transposase  32.98 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.01496  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2203  transposase IS200-family protein  30.49 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1776  hypothetical protein  32.91 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208218 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1173  IS200 family transposase  37.18 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0640  transposase IS200-family protein  28.95 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.363374  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1852  transposase IS200-family protein  28.95 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0725841  normal  0.0149515 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4236  transposase IS200-family protein  30 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3237  IS200 transposase orfA  30.86 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2322  transposase IS200-family protein  34.09 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0666  transposase  32.61 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00248601  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2667  transposase IS200-family protein  34.09 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.370645  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2665  hypothetical protein  33.9 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00833902  hitchhiker  0.00279656 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2011  transposase IS200-family protein  27.59 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.206349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0061  transposase IS200-family protein  31.76 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0415  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
126 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.313771 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0427  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
126 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.465704  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3631  transposase family protein  29.49 
 
 
175 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000970076  normal  0.460332 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0437  transposase IS200-family protein  37.5 
 
 
126 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.769962  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2023  IS605 family transposase  31.08 
 
 
315 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0416  transposase IS200-family protein  31.03 
 
 
134 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.179707  normal  0.0295664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0456  transposase IS200-family protein  31.03 
 
 
134 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.176435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1192  transposase IS200-family protein  31.03 
 
 
134 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.541746  normal  0.0271846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3555  transposase IS200-family protein  31.03 
 
 
134 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3851  transposase IS200-family protein  31.03 
 
 
134 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0764343  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1392  transposase IS200-family protein  34.07 
 
 
138 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000879011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0323  transposase IS200-family protein  29.76 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287972  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3174  transposase IS200-family protein  29.76 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2240  IS200 family transposase  33.33 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1731  hypothetical protein  31.65 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1248  hypothetical protein  26.32 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2521  hypothetical protein  26.32 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.167581  normal  0.919891 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1732  hypothetical protein  31.65 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3107  hypothetical protein  26.32 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.563963  normal  0.438029 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3734  hypothetical protein  26.32 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.231376  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2998  transposase IS200-family protein  26.67 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0423  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0496  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000245422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0062  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.121759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0247  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1892  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0689  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000314281  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0725  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000160762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1004  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1093  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000837902  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1123  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1350  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357115  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1366  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000626279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1499  transposase IS200-family protein  30.95 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000001093  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3079  transposase IS200-family protein  27.27 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.396516  normal  0.172038 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2032  IS605 family transposase  32.05 
 
 
166 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>