More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0559 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0559  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1310    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  62.4 
 
 		 633 aa  869    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  49.35 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2089  hypothetical protein  45.04 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1195  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  38.11 
 
 		 580 aa  404  1e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.500722  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1263  hypothetical protein  43.59 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0437521  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0410  hypothetical protein  43.1 
 
 		 472 aa  393  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0165126  hitchhiker  0.000394368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2578  hypothetical protein  41.76 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1177  hypothetical protein  39.15 
 
 		 509 aa  375  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112818  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0248  hypothetical protein  40.21 
 
 		 491 aa  347  4e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1714  hypothetical protein  39.06 
 
 		 512 aa  346  6e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.414906  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1327  hypothetical protein  33.28 
 
 		 667 aa  339  8e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0188  hypothetical protein  38.55 
 
 		 502 aa  336  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.882321 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0748  hypothetical protein  38.65 
 
 		 503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  31.29 
 
 		 796 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1809  hypothetical protein  31.6 
 
 		 592 aa  303  8.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000370304 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0665  hypothetical protein  30.97 
 
 		 614 aa  301  2e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.545372  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0827  hypothetical protein  31.35 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2060  hypothetical protein  31.19 
 
 		 594 aa  279  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.124935 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1596  hypothetical protein  31.6 
 
 		 594 aa  278  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1122  hypothetical protein  34.86 
 
 		 879 aa  244  5e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.91 
 
 		 880 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  31.25 
 
 		 878 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.52 
 
 		 885 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  30.64 
 
 		 896 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0991  hypothetical protein  34.04 
 
 		 428 aa  177  6e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1726  hypothetical protein  28.35 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.422238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  33.69 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0981  hypothetical protein  32.74 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.534482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1343  hypothetical protein  26.16 
 
 		 441 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0943  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.18 
 
 		 421 aa  150  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1751  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.29 
 
 		 723 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.837837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0790  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.06 
 
 		 784 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0799  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.14 
 
 		 755 aa  108  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5329  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.37 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.176217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.26 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.967474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1749  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.97 
 
 		 234 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.031895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0739  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.84 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00726569  normal  0.0134967 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0037  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.43 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  31.17 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0706  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  24.72 
 
 		 239 aa  67  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2424  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  26.09 
 
 		 234 aa  67  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.238149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2192  phosophoadenylyl-sulfate reductase  24.63 
 
 		 243 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0413  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.36 
 
 		 235 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1294  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0931  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28.65 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.238936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0590  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.85 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8684  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.42 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0830  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  29.76 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3188  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.94 
 
 		 285 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0485468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1567  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.76 
 
 		 224 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.779448  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2468  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.89 
 
 		 240 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.614171  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2337  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.67 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1147  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.76 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0962  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  25.59 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0267313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2458  hypothetical protein  25.19 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1544  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.14 
 
 		 234 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1303  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.87 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1512  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  26.06 
 
 		 234 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000587393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1582  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  24.22 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138804  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3868  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.44 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1304  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.87 
 
 		 234 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1789  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  27.51 
 
 		 267 aa  59.7  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1143  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.39 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.536652  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1300  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.78 
 
 		 342 aa  59.7  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02131  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.68 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0255066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1669  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.11 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.400633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1476  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.7 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2114  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  26.7 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0620  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.69 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1582  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.82 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.356213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0739  hypothetical protein  26.42 
 
 		 496 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.25742  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0833  hypothetical protein  22.62 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1077  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.19 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1344  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  24.85 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0171  sulfurtransferase DndC  24.9 
 
 		 507 aa  57.4  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2262  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.48 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.917723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2474  hypothetical protein  23.35 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.671413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1330  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.53 
 
 		 226 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.334965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0182  putative RNA-binding protein  33.63 
 
 		 161 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0310  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.46 
 
 		 257 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00936884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1440  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  25.53 
 
 		 226 aa  57  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0816  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.37 
 
 		 249 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1300  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  24.47 
 
 		 227 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.88984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2054  phosphoadenylylsulfate reductase (thioredoxin)  24.58 
 
 		 256 aa  56.6  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4083  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.5 
 
 		 251 aa  57  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3992  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.26 
 
 		 245 aa  56.2  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  28.03 
 
 		 652 aa  56.2  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03587  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  27.07 
 
 		 248 aa  56.2  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.845085  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5533  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  23.79 
 
 		 224 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2429  phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  25.25 
 
 		 264 aa  56.2  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.149662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3736  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  26.74 
 
 		 245 aa  55.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2209  hypothetical protein  22.37 
 
 		 566 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3265  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  24.43 
 
 		 258 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242292  normal  0.909122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2200  Phosphoadenylyl-sulfate reductase (thioredoxin)  24.19 
 
 		 239 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.096364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4840  hypothetical protein  23.25 
 
 		 541 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.567316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.8 
 
 		 649 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0527  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  28 
 
 		 223 aa  55.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277121  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4661  sulfate adenylyltransferase, small subunit  25.38 
 
 		 302 aa  55.1  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423363  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1777  adenylylsulfate reductase, thioredoxin dependent  27 
 
 		 238 aa  55.1  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>