256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4067 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  100 
 
 
321 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  53.18 
 
 
322 aa  351  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  47.73 
 
 
307 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.73 
 
 
307 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  41.21 
 
 
313 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  41.75 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  41.41 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  43.45 
 
 
324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  40 
 
 
306 aa  179  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.57 
 
 
314 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2891  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.84 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1887  ATPase  30.64 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1877  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.1 
 
 
327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0965153  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0687  cobalt chelatase, pCobS small subunit  30.22 
 
 
364 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1977  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  30.22 
 
 
364 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.290532  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3076  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.91 
 
 
345 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0914  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.71 
 
 
328 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3425  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.62 
 
 
327 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1946  cobaltochelatase, CobS subunit  29.02 
 
 
328 aa  123  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2560  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.02 
 
 
331 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.438183 
 
 
-
 
NC_004310  BR2022  cobalamin biosynthesis protein, putative  28.71 
 
 
328 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6740  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.93 
 
 
327 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  33.92 
 
 
409 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0222  cobalt chelatase, pCobS small subunit  29.41 
 
 
330 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.71 
 
 
343 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.53 
 
 
331 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3554  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.99 
 
 
327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  0.328272 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  28.17 
 
 
328 aa  119  7e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.75 
 
 
332 aa  119  9e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3230  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.67 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.453158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.62 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3427  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.81 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227982  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.52 
 
 
328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3884  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.3 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.922452  hitchhiker  0.0087584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4046  cobaltochelatase CobS subunit  28.84 
 
 
330 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0554035  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  31.1 
 
 
330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0403  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.48 
 
 
332 aa  116  5e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.154081  normal  0.524708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3591  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.99 
 
 
330 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.721519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2735  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  29.47 
 
 
329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.67 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2711  aerobic cobaltochelatase subunit cobS  28.89 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.672533  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0644  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.3 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.751429  normal  0.0530402 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3698  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.04 
 
 
327 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41569 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 
373 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.48 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0541  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.67 
 
 
331 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0206  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.7 
 
 
329 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218471  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0108  AAA family ATPase  35.43 
 
 
411 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.32776e-96  hitchhiker  3.99922e-135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0711  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.12 
 
 
335 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141534  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3729  ATPase  29.92 
 
 
317 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.96 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0499  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.73 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0287  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.36 
 
 
331 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2189  cobalt chelatase, pCobS small subunit  28.3 
 
 
324 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.560792  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2331  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.01 
 
 
334 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.414847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1997  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  27.76 
 
 
329 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284374  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0538  cobalt chelatase, pCobS small subunit  27.36 
 
 
331 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.408122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4520  cobaltochelatase  27.24 
 
 
328 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0470453  normal  0.475995 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6209  cobaltochelatase  28.53 
 
 
330 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.850781  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0116  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.65 
 
 
343 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0277687  normal  0.0706588 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  29.5 
 
 
301 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1712  cobalt chelatase, pCobS small subunit  26.85 
 
 
338 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3755  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  28.66 
 
 
322 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430731  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  34.36 
 
 
400 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3827  Cobaltochelatase  25.87 
 
 
327 aa  99.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4365  Cobaltochelatase  27.13 
 
 
329 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.633066 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  28.77 
 
 
346 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  26.18 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1994  cobaltochelatase  27.44 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148591  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  27.54 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.74 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.8 
 
 
286 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0603  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.2 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000309159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  28.46 
 
 
265 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  29.87 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  29.87 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4676  putative norQ protein  29.41 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.7049199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  25.81 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.07 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  25.7 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0394  cobalamin biosynthesis CobS-like protein  25.36 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313111  hitchhiker  0.00145489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  28.82 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  28.16 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  28.16 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  28.16 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  28.16 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  28.16 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000358877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  28.82 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  28.16 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  23.75 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  24.8 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  28.82 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  26.8 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  27.32 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  28.39 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  26.96 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.45 
 
 
286 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  27.51 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>