26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3383 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  100 
 
 
351 aa  725    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0004  restriction endonuclease  56.13 
 
 
346 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.689033  hitchhiker  0.00578502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1093  restriction endonuclease  44.44 
 
 
341 aa  295  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  0.32417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1552  hypothetical protein  41.09 
 
 
347 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0825  hypothetical protein  42.77 
 
 
301 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3625  hypothetical protein  32.75 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05230  hypothetical protein  29.57 
 
 
351 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  29.07 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  27.09 
 
 
330 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  27.03 
 
 
363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  26.72 
 
 
342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  29.37 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  28.05 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  25.22 
 
 
328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  25.07 
 
 
345 aa  110  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_002936  DET1113  hypothetical protein  33.56 
 
 
161 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0217966  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05450  GTPase subunit of restriction endonuclease  33.6 
 
 
853 aa  72.8  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  27.55 
 
 
300 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2750  hypothetical protein  30 
 
 
208 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.216943  hitchhiker  0.00281917 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  32.84 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  27.83 
 
 
805 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  31.73 
 
 
296 aa  49.3  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  29 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  31.86 
 
 
454 aa  43.9  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  31.68 
 
 
453 aa  44.3  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  30.59 
 
 
493 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>