More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0228 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl042  dihydrolipate dehydrogenase  65.2 
 
 
602 aa  812    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0228  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
629 aa  1260    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 
470 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 
470 aa  332  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.79 
 
 
467 aa  325  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
470 aa  323  7e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.66 
 
 
470 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 
585 aa  321  3e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 
470 aa  321  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.71 
 
 
473 aa  321  3e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
459 aa  320  6e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 
474 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  34.07 
 
 
584 aa  318  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  39.96 
 
 
466 aa  317  4e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  39.25 
 
 
468 aa  316  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 
463 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
468 aa  314  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
468 aa  314  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.62 
 
 
467 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
459 aa  310  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 
465 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
458 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
459 aa  309  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.6 
 
 
468 aa  309  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.55 
 
 
480 aa  308  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.95 
 
 
462 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.62 
 
 
468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.96 
 
 
466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 
459 aa  306  6e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.95 
 
 
462 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.02 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.64 
 
 
459 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.92 
 
 
466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
462 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0048  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.37 
 
 
472 aa  304  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 
459 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 
459 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.09 
 
 
462 aa  302  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.64 
 
 
459 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.54 
 
 
463 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.2 
 
 
468 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.8 
 
 
468 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 
472 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.64 
 
 
468 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 
459 aa  300  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.93 
 
 
479 aa  300  7e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.45 
 
 
465 aa  300  7e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.22 
 
 
465 aa  299  9e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.79 
 
 
461 aa  299  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.37 
 
 
478 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.89 
 
 
465 aa  299  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
478 aa  299  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.37 
 
 
478 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.81 
 
 
477 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.12 
 
 
467 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.64 
 
 
459 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 
478 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 
478 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.92 
 
 
478 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.49 
 
 
474 aa  297  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.6 
 
 
581 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 
468 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
478 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.76 
 
 
467 aa  296  6e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.74 
 
 
468 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
464 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 
477 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.33 
 
 
478 aa  295  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.47 
 
 
481 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.84 
 
 
476 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 
471 aa  295  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.54 
 
 
478 aa  295  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.38 
 
 
470 aa  294  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
454 aa  294  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 
461 aa  294  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 
474 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.72 
 
 
470 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.37 
 
 
468 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.5 
 
 
463 aa  293  7e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.12 
 
 
478 aa  293  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  38.43 
 
 
500 aa  293  9e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 
471 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.12 
 
 
476 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 
470 aa  292  1e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
476 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
476 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.05 
 
 
465 aa  291  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>