24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2173 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  779    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  42.71 
 
 		 385 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  24.88 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  30.54 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  25.74 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 		 420 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  22.93 
 
 		 410 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  24.88 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  25.56 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  23.65 
 
 		 419 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.15 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  24.94 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  24.72 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  21.18 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  23.89 
 
 		 863 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  26.24 
 
 		 425 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  26.11 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  26.22 
 
 		 399 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>