45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6334 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6334  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4088  MltA-interacting MipA family protein  55.88 
 
 		 292 aa  314  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0206968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0358  MltA-interacting MipA family protein  39.02 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0366987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1574  MltA-interacting MipA family protein  39 
 
 		 265 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0981036  normal  0.104477 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  37.45 
 
 		 277 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1031  MltA-interacting MipA family protein  36.82 
 
 		 273 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  36.71 
 
 		 276 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4640  MltA-interacting MipA family protein  35.27 
 
 		 282 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414378  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3031  MltA-interacting MipA family protein  32.13 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0587  MltA-interacting MipA family protein  35.74 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222677  normal  0.172275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0542  MltA-interacting MipA family protein  35.32 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00487253  normal  0.261768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0476  MltA-interacting MipA family protein  33.05 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0445129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  33.76 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  27.71 
 
 		 288 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  28.86 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  25.97 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  27.52 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  26.58 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  29.3 
 
 		 261 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  26.53 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2823  MltA-interacting MipA  27.49 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3867  MltA-interacting MipA family protein  27.9 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  24.51 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  23.41 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  24.51 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  22.77 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  22.84 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  22.31 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  22.31 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  22.31 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  23.28 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  23.02 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  22.83 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  24.89 
 
 		 378 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  23.18 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  23.71 
 
 		 378 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  24.46 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1351  hypothetical protein  24.89 
 
 		 864 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.52198  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  27.44 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7206  MltA-interacting MipA family protein  22.26 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  30.68 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  22.27 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  23.32 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  34.95 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  24.28 
 
 		 278 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>