More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3285 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  93.01 
 
 
529 aa  1030    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  91.32 
 
 
529 aa  1005    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  64.21 
 
 
546 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  66.39 
 
 
550 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  64.02 
 
 
546 aa  657    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  63.62 
 
 
546 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  64.14 
 
 
552 aa  649    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  63.62 
 
 
546 aa  654    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  64.21 
 
 
546 aa  660    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  68.79 
 
 
543 aa  688    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  92.06 
 
 
529 aa  1025    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  64.14 
 
 
554 aa  659    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  100 
 
 
529 aa  1102    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  92.08 
 
 
530 aa  1019    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  92.08 
 
 
530 aa  1019    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  63.62 
 
 
546 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  63.09 
 
 
551 aa  629  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  61.75 
 
 
552 aa  623  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  60.2 
 
 
555 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  53.29 
 
 
488 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  53.29 
 
 
488 aa  518  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  53.29 
 
 
488 aa  518  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  53.29 
 
 
488 aa  518  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  53.29 
 
 
488 aa  518  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  54.12 
 
 
488 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  53.07 
 
 
488 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  53.29 
 
 
488 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  52.88 
 
 
488 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  52.88 
 
 
488 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  54.41 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  48.88 
 
 
511 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  48.12 
 
 
489 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  49.09 
 
 
511 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  48.88 
 
 
516 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  48.88 
 
 
511 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  48.88 
 
 
505 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  48.48 
 
 
509 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  47.13 
 
 
504 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  47.39 
 
 
505 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  46.67 
 
 
509 aa  428  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  46.51 
 
 
705 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  44.09 
 
 
485 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  46.88 
 
 
701 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  46.34 
 
 
512 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  44.02 
 
 
675 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  44.4 
 
 
504 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  43.96 
 
 
695 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  47.39 
 
 
728 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  44.75 
 
 
567 aa  419  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  47.28 
 
 
702 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  45.93 
 
 
510 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  46.57 
 
 
510 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2311  catalase  46.77 
 
 
737 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  47.28 
 
 
702 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  45.58 
 
 
705 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  44.07 
 
 
710 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  46 
 
 
695 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61040  catalase  45.77 
 
 
513 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  44.57 
 
 
735 aa  415  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5253  catalase  45.56 
 
 
513 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0672841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  45.84 
 
 
507 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  46.14 
 
 
515 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  44.7 
 
 
705 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2032  catalase  45.49 
 
 
513 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.534107  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  44.84 
 
 
490 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3940  catalase  44.2 
 
 
493 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.109711  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1180  Catalase  46.37 
 
 
704 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  43.37 
 
 
527 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  43.74 
 
 
479 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3394  catalase  43.4 
 
 
503 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.841138  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  45.73 
 
 
808 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  44.53 
 
 
506 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  45.83 
 
 
799 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  45.1 
 
 
704 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  45.17 
 
 
690 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  44.72 
 
 
688 aa  412  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5310  Catalase  44.51 
 
 
702 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  43.75 
 
 
713 aa  410  1e-113  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  46.68 
 
 
517 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  44.33 
 
 
490 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  44.53 
 
 
506 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  46.29 
 
 
848 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  45.1 
 
 
705 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  43.53 
 
 
479 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  45.47 
 
 
794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  43.99 
 
 
720 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  43.97 
 
 
481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  43.46 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  44.25 
 
 
490 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  43.03 
 
 
484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  45.29 
 
 
700 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  44.12 
 
 
536 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  45.69 
 
 
709 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  45.1 
 
 
694 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  43.33 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3991  catalase  46.02 
 
 
713 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.805138  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  44.23 
 
 
689 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  45.29 
 
 
709 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3392  Catalase  43.7 
 
 
491 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0894  catalase  43.81 
 
 
491 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>