More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2066 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 265 aa  513  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  91.32 
 
 		 265 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  77.36 
 
 		 267 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  76.98 
 
 		 267 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  76.98 
 
 		 267 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  72.83 
 
 		 265 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  69.17 
 
 		 279 aa  355  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  69.17 
 
 		 268 aa  354  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  65.04 
 
 		 270 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  67.19 
 
 		 277 aa  338  5e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  65.66 
 
 		 272 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  64.15 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  67.29 
 
 		 274 aa  327  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  66.92 
 
 		 277 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  67.67 
 
 		 274 aa  324  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  66.54 
 
 		 272 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  63.12 
 
 		 268 aa  322  6e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  63.12 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  64.64 
 
 		 269 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  64.64 
 
 		 269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  63.88 
 
 		 269 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  60.9 
 
 		 271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  57.89 
 
 		 268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  58.49 
 
 		 271 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  59.7 
 
 		 269 aa  301  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  58.49 
 
 		 288 aa  301  8.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  60.38 
 
 		 269 aa  300  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  57.36 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  57.74 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  59.62 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  60.75 
 
 		 271 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  60 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  59.62 
 
 		 271 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  58.11 
 
 		 265 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  51.14 
 
 		 268 aa  246  2e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 263 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 263 aa  244  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  48.68 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 268 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  51.32 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 269 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 268 aa  239  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 273 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  238  6.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  48.86 
 
 		 267 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 273 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 266 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  48.48 
 
 		 267 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 270 aa  235  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  52.27 
 
 		 270 aa  234  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 265 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  47.92 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 273 aa  231  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 273 aa  231  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  45.59 
 
 		 276 aa  232  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  51.14 
 
 		 270 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  46.42 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 267 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  52.08 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 		 265 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 		 267 aa  231  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  45.98 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  46.82 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2289  Dihydrodipicolinate reductase  50.76 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2663  dihydrodipicolinate reductase  50.76 
 
 		 276 aa  228  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  47.35 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  48.3 
 
 		 273 aa  228  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  49.62 
 
 		 269 aa  228  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  47.17 
 
 		 273 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>