More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2013 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2013  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 461 aa  919    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0847443  normal  0.208384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  76.17 
 
 		 496 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  76.17 
 
 		 496 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  75.91 
 
 		 496 aa  555  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  64.43 
 
 		 486 aa  486  1e-136  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  54.77 
 
 		 549 aa  422  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  53.88 
 
 		 566 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2749  amino acid permease-associated region  55 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.633141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  55.06 
 
 		 478 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  50.65 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  53.65 
 
 		 480 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  52.81 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  47.22 
 
 		 482 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  52.62 
 
 		 486 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  50.39 
 
 		 483 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  50.13 
 
 		 496 aa  345  8.999999999999999e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1663  amino acid permease-associated region  50.93 
 
 		 496 aa  336  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191833  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  47.09 
 
 		 486 aa  332  9e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  47.09 
 
 		 486 aa  332  9e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  47.51 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  46.29 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  46.37 
 
 		 495 aa  326  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  46.43 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5170  amino acid permease-associated region  44.84 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.892102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3284  amino acid transporter  49.64 
 
 		 503 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0923  amino acid permease  46.8 
 
 		 495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  46.23 
 
 		 488 aa  319  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  48.18 
 
 		 476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  50.68 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  45.71 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  47.27 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  47.27 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  47.27 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  47.27 
 
 		 471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  46.92 
 
 		 492 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  45.8 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  48.56 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06078  cationic amino acid transporter  47.71 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0210338  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  45.45 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  47.67 
 
 		 488 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00849  cationic amino acid transporter  47.71 
 
 		 476 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000255765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  43.67 
 
 		 500 aa  302  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  46.63 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  47.99 
 
 		 464 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2516  amino acid permease-associated region  45.48 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1838  amino acid permease-associated region  49.07 
 
 		 517 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0590  amino acid permease-associated region  49.75 
 
 		 489 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.806794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  43.01 
 
 		 506 aa  296  7e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  46.37 
 
 		 465 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  47.93 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  44.9 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  44.9 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  44.9 
 
 		 467 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  40.9 
 
 		 489 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  44.9 
 
 		 467 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  44.9 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  44.9 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  44.9 
 
 		 467 aa  289  9e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  44.9 
 
 		 467 aa  289  9e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  44.9 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  44.9 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  46.09 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1815  amino acid permease-associated region  45.01 
 
 		 491 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4398  amino acid permease-associated region  47.95 
 
 		 488 aa  286  7e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.465101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  46.49 
 
 		 468 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  46.23 
 
 		 468 aa  286  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  46.75 
 
 		 466 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1784  amino acid permease-associated region  47.98 
 
 		 475 aa  285  8e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  46.49 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  46.49 
 
 		 468 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  47.28 
 
 		 465 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0743  amino acid permease-associated region  49.87 
 
 		 494 aa  285  9e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0198333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  46.23 
 
 		 466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  46.23 
 
 		 466 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  41.91 
 
 		 518 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  40.93 
 
 		 471 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  45.55 
 
 		 466 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  39.37 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  39.47 
 
 		 463 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  44.96 
 
 		 501 aa  281  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  44.07 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  39.64 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  40.41 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  39.64 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  39.64 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  39.64 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  39.64 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  39.64 
 
 		 471 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  41.79 
 
 		 525 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  39.64 
 
 		 471 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  39.9 
 
 		 471 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1589  amino acid permease-associated region  41.56 
 
 		 539 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.984032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  42.97 
 
 		 510 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4179  amino acid permease-associated region  45.34 
 
 		 517 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  45.81 
 
 		 463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  44.78 
 
 		 478 aa  273  6e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  46.23 
 
 		 467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1409  cationic amino acid transporter  45.41 
 
 		 464 aa  270  5e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.173334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  45.97 
 
 		 467 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  45.97 
 
 		 467 aa  269  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>