More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1507 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1507  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
699 aa  1403    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.19 
 
 
522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.06 
 
 
534 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2506  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.94 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.29 
 
 
467 aa  141  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.59 
 
 
626 aa  140  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2534  DNA-directed DNA polymerase  34.45 
 
 
614 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.505064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.43 
 
 
518 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0741  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.91 
 
 
455 aa  137  5e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0511  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.45 
 
 
614 aa  137  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4903  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.51 
 
 
731 aa  137  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742776  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.08 
 
 
460 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1572  DNA polymerase III, tau subunit  31.01 
 
 
572 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.13387  hitchhiker  0.00000463974 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.69 
 
 
478 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.38 
 
 
501 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7084  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.76 
 
 
634 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1975  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.66 
 
 
632 aa  135  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.868951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.69 
 
 
478 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1138  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.42 
 
 
550 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0632409  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.4 
 
 
565 aa  134  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  27.4 
 
 
565 aa  134  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1457  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.19 
 
 
647 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.5 
 
 
540 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0934  ATPase  32.46 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.894546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.08 
 
 
517 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  36.21 
 
 
900 aa  131  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1670  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.51 
 
 
605 aa  132  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.595012 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.39 
 
 
735 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.59 
 
 
568 aa  130  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1510  DNA polymerase III, tau subunit / DNA polymerase III, gamma subunit  33.94 
 
 
648 aa  130  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0569414  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0828  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.02 
 
 
554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1468  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.41 
 
 
627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.87 
 
 
565 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2005  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.26 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.45 
 
 
701 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.418663  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.1 
 
 
601 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0331  hypothetical protein  32.2 
 
 
629 aa  128  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.517311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.1 
 
 
601 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.2 
 
 
582 aa  129  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.1 
 
 
606 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1399  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.85 
 
 
716 aa  129  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.81 
 
 
582 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.81 
 
 
580 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1507  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.01 
 
 
678 aa  127  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.64 
 
 
606 aa  127  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0015  DNA polymerase III subunit gamma/tau  30.18 
 
 
548 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0942  DNA-directed DNA polymerase  25.83 
 
 
491 aa  127  8.000000000000001e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.59 
 
 
755 aa  126  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2593  DNA-directed DNA polymerase  34.09 
 
 
529 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11541  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2350  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.61 
 
 
679 aa  126  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.156854  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2330  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.77 
 
 
620 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1073  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.92 
 
 
553 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25950  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  30.85 
 
 
796 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  32.14 
 
 
652 aa  126  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1858  DNA-directed DNA polymerase  33.91 
 
 
580 aa  126  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5277  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.7 
 
 
618 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028048  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.7 
 
 
616 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.04 
 
 
622 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0414  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.27 
 
 
872 aa  126  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.69984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2269  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.04 
 
 
688 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4998  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.7 
 
 
616 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.95 
 
 
518 aa  125  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.21 
 
 
664 aa  125  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0692  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.27 
 
 
682 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.98 
 
 
807 aa  125  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.78 
 
 
554 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000022733  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.51 
 
 
611 aa  124  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0950425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.71 
 
 
599 aa  124  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04710  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  31.71 
 
 
872 aa  124  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2909  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.05 
 
 
687 aa  124  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0213338 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.43 
 
 
589 aa  124  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.92 
 
 
649 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1976  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.96 
 
 
650 aa  124  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0621035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0252  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.03 
 
 
834 aa  123  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0123718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2129  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.05 
 
 
795 aa  123  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.25169  normal  0.3831 
 
 
-
 
NC_002620  TC0611  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.73 
 
 
465 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21271  DNA polymerase, gamma and tau subunits  33.47 
 
 
565 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.11 
 
 
650 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.46 
 
 
591 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.775776  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3125  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.1 
 
 
878 aa  123  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0603821  decreased coverage  0.0000225707 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1750  DNA polymerase III, tau subunit  31.67 
 
 
579 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00401811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.77 
 
 
582 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.62 
 
 
384 aa  123  9.999999999999999e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.79 
 
 
610 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0644  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.15 
 
 
558 aa  123  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.453293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.47 
 
 
643 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.62 
 
 
736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0213  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.03 
 
 
808 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02650  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  34.19 
 
 
1159 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0736  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  29.81 
 
 
602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.536606  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.32 
 
 
678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3649  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 
592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.89772  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  28.26 
 
 
642 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18671  DNA polymerase, gamma and tau subunits  30.36 
 
 
584 aa  122  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.181287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0650  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.57 
 
 
587 aa  122  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0107119  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.88 
 
 
687 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.7 
 
 
582 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.88 
 
 
689 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1256  DNA polymerase III, tau subunit  33.05 
 
 
565 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.303373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0195  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.7 
 
 
579 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.92139e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>