282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1650 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1650  Ferritin, Dps family protein  100 
 
 
155 aa  321  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0767  peroxide resistance protein,non-heme iron-containing ferritin  53.06 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00169224  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1750  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  49.02 
 
 
160 aa  153  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0554  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  45.03 
 
 
155 aa  151  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.38419e-16 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2311  non-heme iron-binding ferritin  42.18 
 
 
148 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0371434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3626  Ferritin Dps family protein  30.99 
 
 
146 aa  90.9  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2788  Ferritin Dps family protein  30 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0475826  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1875  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0581832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1871  general stress protein  30.71 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2013  general stress protein  30.71 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2015  DNA protection during starvation protein 1  30.71 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3294  DNA protection during starvation protein 1  30.71 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.623838 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2092  general stress protein  30.71 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.233989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1841  non-specific DNA-binding protein Dps  30.71 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.150285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1825  non-specific DNA-binding protein, Dps-like  30.71 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2126  DNA protection during starvation protein 1  30.71 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2047  DNA protection during starvation protein 1  30.71 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00820011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0585  Ferritin Dps family protein  27.14 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4778  Dps family protein  30.99 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000253155  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1748  Dps family protein  29.17 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0322  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.58 
 
 
178 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5191  general stress protein 20U  30.99 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4914  general stress protein 20U  30.99 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.770524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4759  Dps family protein  30.99 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5196  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00364208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5290  general stress protein 20U  30.99 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5205  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5159  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.06041e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0052  DNA protection during starvation protein 2  30.99 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000618139  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2175  Ferritin, Dps family protein  26.9 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.728461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4966  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.76 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.933657  hitchhiker  0.0000112331 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2213  Ferritin Dps family protein  26.9 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.716736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1520  Ferritin Dps family protein  29.29 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.907687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4875  Ferritin Dps family protein  29.58 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1585  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.78 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0156974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1497  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.37 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000580086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1771  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.37 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026009  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1602  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.37 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2877  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.34 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000573167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2476  Ferritin Dps family protein  28.57 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.225873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3808  Ferritin Dps family protein  33.09 
 
 
145 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000002907  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2149  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.66 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2062  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.66 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.334508  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0926  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.28 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0980  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.28 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.28 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.558858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0959  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.28 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0896  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.28 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.686485  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0762  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.57 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.654997  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1767  Ferritin, Dps family protein  26.4 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2510  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  29.25 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0829  Ferritin Dps family protein  29.66 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0800  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.62 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.388043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1481  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.66 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2487  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  25.9 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00779  DNA protection during starvation conditions  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2830  Ferritin Dps family protein  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.11817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0961  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256764  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2890  Ferritin Dps family protein  28.38 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.18015  normal  0.244288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2831  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0881  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000444626  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2536  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000397049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00796  hypothetical protein  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0868  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000196372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0836  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  27.59 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0126376  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0327  Ferritin Dps family protein  29.08 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0281  Ferritin and Dps  29.25 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.826391  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4423  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  28.87 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1299  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.21 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.465743  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7797  DNA protection during starvation protein (DNA-binding ferritin-like protein)  26.28 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245311  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3912  Ferritin Dps family protein  24.11 
 
 
160 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.530114 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0735  Ferritin and Dps  24.14 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3484  DNA starvation/stationary phase protection protein Dps  26.57 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A05  DNA-binding ferritin-like protein  27.34 
 
 
183 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1541  Ferritin, Dps family protein  28.26 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103118  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1729  Ferritin Dps family protein  30 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.910338  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1852  Ferritin and Dps  28.77 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.206437  normal  0.245818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0734  Ferritin Dps family protein  27.34 
 
 
157 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1620  putative DNA-binding protein, Dps  30.22 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00952275  normal  0.23564 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0799  hypothetical protein  27.66 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.597246  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0090  Dps family protein  28.37 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0858157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3577  Ferritin, Dps family protein  26.76 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0321644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4559  Ferritin Dps family protein  28.86 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.276191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1333  Ferritin Dps family protein  25.38 
 
 
178 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0377707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2520  ferritin  25.38 
 
 
179 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0599  Ferritin and Dps  30.61 
 
 
175 aa  57.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3044  Ferritin, Dps family protein  25.35 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0512892  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2692  ferritin Dps family protein  28 
 
 
191 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.119491  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2838  Ferritin, Dps family protein  26.76 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232041  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2829  Ferritin Dps family protein  27.34 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.901584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1549  Ferritin Dps family protein  26.06 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2007  Ferritin, Dps family protein  28 
 
 
162 aa  57  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.779211  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2953  Ferritin and Dps  27.86 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1076  Ferritin Dps family protein  26.03 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5451  Ferritin, Dps family protein  27.4 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36300  DNA-binding ferritin-like protein (oxidative damage protectant)  25.53 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.414933 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0085  Ferritin Dps family protein  25.69 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5072  Ferritin and Dps  27.4 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5160  Ferritin, Dps family protein  27.4 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.221838  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1406  Ferritin Dps family protein  26.9 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.2229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>