More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1626 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1626  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 216 aa  431  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0446  hypothetical protein  39.9 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00101815  normal  0.235304 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  40.18 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  36.32 
 
 		 253 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0664  hypothetical protein  34.82 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  35.21 
 
 		 212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  35.55 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0687  DedA family protein, putative  40.2 
 
 		 212 aa  136  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00613405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  35.85 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  39.68 
 
 		 224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  35.48 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  35.38 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  35.48 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  35.48 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  35.48 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  35.48 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  36.54 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  35.48 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  35.48 
 
 		 283 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  36.36 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  35.42 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  35.42 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  34.86 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  36.17 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  34.5 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  34.42 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  33.49 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  36.08 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  34 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  34 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  34 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  37.2 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  38.98 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  36.13 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  35.38 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  34.47 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  34.47 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  34.47 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  34.47 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  34.47 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  34.47 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  34.86 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  34.47 
 
 		 219 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  34.47 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  37.7 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  37.93 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  35.85 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 		 244 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  35.85 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  39.69 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  36.32 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  33.98 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  34.86 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  34.76 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  34.17 
 
 		 221 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  35.86 
 
 		 252 aa  124  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  33.67 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  33.5 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0686  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.47961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  34.74 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  34.27 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  39.68 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  33.48 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  35.38 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  35.38 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02320  uncharacterized membrane-associated protein  36.79 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  33.64 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  35.32 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  34.86 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  36.79 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  33.02 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  34.67 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01570  uncharacterized membrane-associated protein  38.71 
 
 		 235 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  31.6 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  32.42 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  34.54 
 
 		 215 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  33.49 
 
 		 213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  31.48 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2641  SNARE associated Golgi protein  39.66 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  32.41 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  34.67 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  34.7 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  34.65 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  31.12 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  35.45 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  35.08 
 
 		 244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  31.32 
 
 		 214 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  35.94 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  37.88 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  35.29 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  35.5 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.5 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  32.98 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  32.98 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  32.98 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  35.05 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  33.64 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  34.34 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>