245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1311 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000318838 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1895  ISAfe1, transposase  80.95 
 
 		 342 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3183  ISAfe1, transposase  80.95 
 
 		 342 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1569  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.95 
 
 		 342 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196029 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2781  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.95 
 
 		 342 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  80.95 
 
 		 342 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000595927 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4812  hypothetical protein  46.34 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.430232  hitchhiker  0.00508797 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0485  putative transposase IS116/IS110/IS902  58.73 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0324291  normal  0.781699 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6580  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.84 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0128065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.58 
 
 		 346 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1396  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.58 
 
 		 346 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.199671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1747  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  57.58 
 
 		 346 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  44.23 
 
 		 341 aa  74.7  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2240  transposase, IS1111 family  49.21 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000963569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3882  transposase, IS1111 family  49.21 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2913  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.31 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6180  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.45 
 
 		 336 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.626192  hitchhiker  0.00140825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3762  putative transposase  50 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.915156 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4127  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  57.63 
 
 		 253 aa  68.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177688  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  52.38 
 
 		 346 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  48.05 
 
 		 338 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  48.05 
 
 		 338 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.21 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  48.05 
 
 		 338 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  50.79 
 
 		 338 aa  64.7  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  50.79 
 
 		 338 aa  64.7  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  50.79 
 
 		 338 aa  64.7  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.31 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0943  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.4 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  51.61 
 
 		 342 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0944  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.4 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  38.24 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.58 
 
 		 340 aa  62  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  50 
 
 		 342 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1434  hypothetical protein  48.39 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3485  hypothetical protein  51.61 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.145421 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3450  hypothetical protein  48.39 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.51037  normal  0.264897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.03 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0804  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  46.15 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796908  hitchhiker  0.00222246 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.75 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.54 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  43.55 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  43.55 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  47.37 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1640  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  49.21 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000188647  unclonable  0.00000000000190741 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.03 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.03 
 
 		 343 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2472  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0853  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.62 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.55 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3847  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.62 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  46.77 
 
 		 343 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  48.39 
 
 		 341 aa  57.8  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7434  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.98 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.9 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3664  hypothetical protein  47.62 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000781858 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.55 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0592  transposase IS116/IS110/IS902  46.03 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0881  transposase IS116/IS110/IS902  46.03 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1332  transposase IS116/IS110/IS902  46.03 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3445  transposase IS116/IS110/IS902  46.03 
 
 		 338 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 341 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.86 
 
 		 341 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0965  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1574  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168491 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1966  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2010  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.657114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2061  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.232183  normal  0.150463 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2092  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3124  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3160  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0233772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3275  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3642  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.404408  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4440  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4622  transposase IS116/IS110/IS902  41.94 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  45.61 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3666  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.03 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0314805 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0079  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.03 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0841  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.03 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767297 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3805  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.03 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  41.27 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  41.27 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02591  hypothetical protein  43.86 
 
 		 355 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  43.86 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1114  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  43.86 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  43.86 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  43.86 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3161  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3976  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.015525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3467  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4213  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0222  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0406  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.621929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1779  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.44 
 
 		 338 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4711  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  44.62 
 
 		 338 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.266875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>