More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0335 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0335  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0904  MCP methyltransferase, CheR-type  46.3 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3546  MCP methyltransferase, CheR-type  44.07 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  0.882443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  46.01 
 
 		 269 aa  225  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0910  chemotaxis protein methyltransferase CheR  42.44 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0783  protein-glutamate O-methyltransferase  42.44 
 
 		 269 aa  222  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827996  normal  0.901412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1528  MCP methyltransferase, CheR-type  46.62 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.168715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  41.73 
 
 		 275 aa  219  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04754  CheR methyltransferase, SAM binding domain  41.35 
 
 		 268 aa  218  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1565  protein-glutamate O-methyltransferase  43.82 
 
 		 269 aa  212  7e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.724121  normal  0.553309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2325  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.69 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1146  MCP methyltransferase, CheR-type  38.81 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.492811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0267  protein-glutamate O-methyltransferase  43.73 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.647736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2622  chemotaxis methyltransferase CheR  39.92 
 
 		 286 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206628 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2177  chemotaxis methyltransferase CheR  39.92 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1748  chemotaxis methyltransferase CheR  39.92 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01855  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  39.92 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.435118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1756  MCP methyltransferase, CheR-type  39.92 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0553359  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4376  MCP methyltransferase, CheR-type  41.27 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.525329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01844  hypothetical protein  39.92 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1980  chemotaxis methyltransferase CheR  39.92 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2117  chemotaxis methyltransferase CheR  39.53 
 
 		 286 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.396301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2618  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2608  chemotaxis methyltransferase CheR  40.94 
 
 		 290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1300  chemotaxis methyltransferase CheR  39.13 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000891589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1858  chemotaxis methyltransferase CheR  40.55 
 
 		 290 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1595  MCP methyltransferase, CheR-type  36.76 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1756  chemotaxis methyltransferase CheR  42.52 
 
 		 295 aa  178  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.456402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0466  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176521 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3518  chemotaxis methyltransferase CheR  42.52 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.577755 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2133  chemotaxis methyltransferase CheR  39.36 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000021864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1327  chemotaxis methyltransferase CheR  39.36 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000151288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1644  chemotaxis methyltransferase CheR  42.52 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2078  chemotaxis methyltransferase CheR  39.36 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.687941  hitchhiker  2.73756e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2073  chemotaxis methyltransferase CheR  39.36 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.50771  hitchhiker  0.000251677 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1204  chemotaxis methyltransferase CheR  39.36 
 
 		 288 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1845  MCP methyltransferase, CheR-type  39.13 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.516279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1143  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.36 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0207024  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0239  protein-glutamate O-methyltransferase  40.68 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1515  chemotaxis methyltransferase CheR  38.19 
 
 		 290 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1587  chemotaxis methyltransferase, CheR2  40.3 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2420  MCP methyltransferase, CheR-type  37.09 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.503139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4819  MCP methyltransferase, CheR-type  43.41 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  hitchhiker  0.00962017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1539  protein-glutamate O-methyltransferase  33.57 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2455  chemotaxis methyltransferase CheR  39.36 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1543  chemotaxis methyltransferase CheR  38.58 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.520759  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0241  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 		 325 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0215152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6731  MCP methyltransferase, CheR-type  37.73 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0168  MCP methyltransferase, CheR-type  41.22 
 
 		 328 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3361  MCP methyltransferase, CheR-type  40.98 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0405517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  40.56 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2848  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.242371  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2984  protein-glutamate O-methyltransferase  35.9 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0259  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0185  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0172  MCP methyltransferase, CheR-type  41.39 
 
 		 325 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.581337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3788  MCP methyltransferase, CheR-type  40.56 
 
 		 297 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0657  MCP methyltransferase, CheR-type  39.68 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0730  MCP methyltransferase, CheR-type  37.7 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0443063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5610  MCP methyltransferase, CheR-type  40.4 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  35.02 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7834  MCP methyltransferase, CheR-type  37.23 
 
 		 275 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3179  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.43 
 
 		 314 aa  168  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0757  MCP methyltransferase, CheR-type  35.32 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  41.09 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2981  chemotaxis methyltransferase CheR  40.56 
 
 		 290 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  40.7 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3119  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.43 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2856  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.43 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0073  chemotaxis protein methyltransferase  39.43 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3933  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.43 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3691  chemotaxis regulator, protein-glutamate methyltransferase  38.89 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00198927  normal  0.0225149 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1687  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.43 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.460756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3852  chemotaxis protein methyltransferase  39.43 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2215  MCP methyltransferase, CheR-type  37.35 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.556164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0569  MCP methyltransferase, CheR-type  39.76 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.429442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3811  MCP methyltransferase, CheR-type  39.18 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0700  MCP methyltransferase, CheR-type  38.1 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.531661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1884  MCP methyltransferase, CheR-type  36.72 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0878954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1043  MCP methyltransferase, CheR-type  42.06 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0141  MCP methyltransferase, CheR-type  37.32 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0351158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2166  protein-glutamate O-methyltransferase  36.89 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00016475  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3204  MCP methyltransferase, CheR-type  37.97 
 
 		 285 aa  166  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.25041  normal  0.841939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00055  chemotaxis protein methyltransferase 2  36.76 
 
 		 286 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00310975  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0601  MCP methyltransferase, CheR-type  40.54 
 
 		 299 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24390  protein-glutamate O-methyltransferase. chemotaxis protein  37.55 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.273905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3218  MCP methyltransferase, CheR-type  41.04 
 
 		 295 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2090  MCP methyltransferase, CheR-type  36.72 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.853389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  32.96 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.299383  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4669  MCP methyltransferase, CheR-type  36.9 
 
 		 283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.225745  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1932  MCP methyltransferase, CheR-type  36.65 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4154  MCP methyltransferase, CheR-type  36.8 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1405  MCP methyltransferase, CheR-type  37.82 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.216379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1077  MCP methyltransferase, CheR-type  37.9 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2105  MCP methyltransferase, CheR-type  30.77 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1731  MCP methyltransferase, CheR-type  34.3 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0645  protein-glutamate O-methyltransferase  40.78 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0464454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1617  MCP methyltransferase, CheR-type  36.95 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0875  MCP methyltransferase, CheR-type  34.96 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22590  Protein-glutamate O-methyltransferase  35.55 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>