70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0257 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  500  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1482  hypothetical protein  42.41 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3645  integral membrane protein  42.25 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.258813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3045  integral membrane protein  37.16 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319119  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1524  integral membrane-like protein  40 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3048  integral membrane protein  39.92 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.702381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0963  hypothetical protein  37.8 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089568 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2413  integral membrane protein  37.8 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.696522  hitchhiker  0.0019684 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1473  hypothetical protein  37.55 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1270  integral membrane protein  36.21 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.731901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1233  integral membrane protein  33.89 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3983  hypothetical protein  36.36 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1576  integral membrane protein  39.69 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4138  hypothetical protein  35.57 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3410  integral membrane protein  35.93 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4241  integral membrane protein  38.68 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2564  integral membrane protein  37.11 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.479216  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0009  integral membrane protein  37.6 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1602  integral membrane protein  35.16 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1053  integral membrane protein  38.82 
 
 		 288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2272  integral membrane protein  34.77 
 
 		 278 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.297737  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1050  integral membrane protein  34.15 
 
 		 291 aa  118  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.143905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2727  hypothetical protein  36.73 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.366469  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3447  hypothetical protein  34.36 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0848304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5921  hypothetical protein  36.25 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206113  normal  0.388668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2254  integral membrane protein-like  33.46 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.065811  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3771  integral membrane protein  37.97 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1157  integral membrane protein  34.98 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522859  normal  0.049297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01073  putative cytochrome c oxidase, subunit I  30.23 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2035  putative cytochrome c oxidase, subunit I  32.54 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4475  hypothetical protein  35.44 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2132  conserved hypothetical conserved membrane protein  32.32 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0978779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1998  integral membrane protein  34.57 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1737  putative cytochrome c oxidase, subunit I  30.92 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6788  hypothetical protein  34.15 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101471  normal  0.0851978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5347  hypothetical protein  38.92 
 
 		 264 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.0426067 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1923  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.46 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1855  integral membrane protein-like protein  31.08 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6089  hypothetical protein  35.2 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.666814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1194  cytochrome c oxidase subunit I  36.32 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.25451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1866  hypothetical protein  30.8 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.31982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0330  cytochrome c oxidase subunit I  32.95 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2133  Protein of unknown function DUF2189, transmembrane  28.91 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.148345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03569  hypothetical protein  30.74 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2770  hypothetical protein  32.74 
 
 		 318 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.20072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2976  hypothetical protein  30.28 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1622  hypothetical protein  30.28 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.559223  normal  0.211497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002466  putative cytochrome c oxidase subunit I  30.74 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2771  hypothetical protein  32.42 
 
 		 300 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.439667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0871  hypothetical protein  30.23 
 
 		 269 aa  95.5  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.99358  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3899  cytochrome c oxidase subunit I  32.81 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2479  cytochrome c oxidase subunit I  33.33 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2726  hypothetical protein  32.03 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1797  integral membrane-like protein  34.5 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.797303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2531  hypothetical protein  33.47 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.849481  normal  0.0611922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0153  hypothetical protein  32.45 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242338 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3414  hypothetical protein  34.47 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1174  hypothetical protein  32.54 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0226472  normal  0.695138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1494  hypothetical protein  34.6 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.452839  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4036  integral membrane protein  33.61 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2357  cytochrome c oxidase subunit I  32.41 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3166  hypothetical protein  32.14 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.370375  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1763  hypothetical protein  29.84 
 
 		 309 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168162  normal  0.0214362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4394  hypothetical protein  30.61 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0476176 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0621  cytochrome c oxidase subunit I  29.23 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0229619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1805  hypothetical protein  29.21 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2775  integral membrane protein-like protein  31.6 
 
 		 284 aa  75.1  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2731  hypothetical protein  29.44 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471338  normal  0.518668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3013  hypothetical protein  26.14 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3976  ParB-like partition protein  21.29 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.180656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>