More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1065 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1086  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  58.81 
 
 
640 aa  788    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1065  Na+/lactose symporter related transporter  100 
 
 
639 aa  1278    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0728  Na+/xyloside symporter  52.67 
 
 
495 aa  502  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0449813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  47.28 
 
 
470 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0305  Na+/xyloside symporter or related transporter  43.4 
 
 
479 aa  429  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0574168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0880  Na+/xyloside symporter related transporter  39.22 
 
 
640 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1367  Na+/xyloside symporter or related transporter  34.85 
 
 
634 aa  392  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.316422  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2246  Na+/xyloside symporter related transporter  44.66 
 
 
462 aa  390  1e-107  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1768  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  37.14 
 
 
650 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000025521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1454  sugar transporter  30.57 
 
 
454 aa  231  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1935  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.5 
 
 
461 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0071  melibiose:sodium symporter  26.67 
 
 
448 aa  134  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00245996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  25.1 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  25.1 
 
 
469 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  24.69 
 
 
481 aa  132  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  25.1 
 
 
473 aa  132  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  25.1 
 
 
473 aa  132  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  25.1 
 
 
473 aa  132  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4645  melibiose:sodium symporter  25.69 
 
 
476 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.1 
 
 
469 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  25.42 
 
 
481 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4563  melibiose:sodium symporter  25.48 
 
 
476 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4694  melibiose:sodium symporter  25.48 
 
 
476 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4645  melibiose:sodium symporter  25.48 
 
 
476 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4554  melibiose:sodium symporter  25.48 
 
 
476 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  22.78 
 
 
467 aa  103  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2105  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  32.39 
 
 
724 aa  103  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.684712  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0192  PTS system, IIABC components  29.44 
 
 
676 aa  101  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.83 
 
 
463 aa  101  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  21.99 
 
 
465 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.06 
 
 
480 aa  99.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.06 
 
 
467 aa  98.6  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0174  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  37.01 
 
 
681 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0179  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  37.01 
 
 
681 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  24.76 
 
 
459 aa  97.4  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1778  sucrose PTS, EIIBCA  30.43 
 
 
647 aa  97.4  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000018652  hitchhiker  0.000000000675608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  22.83 
 
 
462 aa  95.9  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0288  sucrose PTS, EIIBCA  37.2 
 
 
653 aa  95.9  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0534348  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  21.61 
 
 
454 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1669  trehalose PTS trehalose component IIBC  32.09 
 
 
672 aa  95.5  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  23.29 
 
 
442 aa  95.1  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  21.61 
 
 
454 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0758  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  38.35 
 
 
653 aa  95.1  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.573965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1710  sucrose PTS, EIIBCA  33.99 
 
 
633 aa  94.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.05 
 
 
460 aa  94  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0747  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  33.33 
 
 
638 aa  94  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1768  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  31.82 
 
 
751 aa  94  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.95 
 
 
471 aa  93.6  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2439  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  33.53 
 
 
633 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0763  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  34.46 
 
 
626 aa  91.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.13 
 
 
478 aa  92  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0398  sucrose PTS, EIIBCA  33.13 
 
 
654 aa  92  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000327344  hitchhiker  0.00000162153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2740  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  29.55 
 
 
619 aa  91.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1704  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  28.49 
 
 
636 aa  91.3  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.13733  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.13 
 
 
478 aa  90.9  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5442  putative PTS system, glucose-specific IIA component  42.34 
 
 
165 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000107285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5445  PTS system, glucose-specific IIA component, putative  42.34 
 
 
165 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5509  putative PTS system, glucose-specific IIA component  42.34 
 
 
165 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5169  PTS system glucose-specific transporter subunit IIA  42.34 
 
 
165 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000010415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5019  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase, PTS system, IIA component  42.34 
 
 
165 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000303487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5563  PTS system glucose-specific transporter subunit IIA  42.34 
 
 
165 aa  90.9  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000151282  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5498  putative PTS system, glucose-specific IIA component  42.34 
 
 
165 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000128176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5411  putative PTS system, glucose-specific IIA component  42.34 
 
 
165 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.85272e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5118  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  42.34 
 
 
165 aa  90.5  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2742  PTS system beta-glucoside-specific transporter subunits IIABC  33.54 
 
 
633 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5003  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase, PTS system, IIA component  43.52 
 
 
165 aa  90.5  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.0907700000000005e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0542  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  32.65 
 
 
642 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2548  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  31.95 
 
 
641 aa  89.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.66 
 
 
442 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3841  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  41.44 
 
 
165 aa  89  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000588614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0239  phosphotransferase system IIA component  34.35 
 
 
164 aa  89  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1459  PTS system, glucose-specific IIBC subunit  35.42 
 
 
658 aa  89.4  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0104386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1353  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  34.62 
 
 
613 aa  88.6  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 
441 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.37 
 
 
441 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.66 
 
 
441 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.66 
 
 
442 aa  88.2  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3314  glucuronide transporter  22.3 
 
 
457 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.56 
 
 
442 aa  87.8  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  21.68 
 
 
460 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  21.68 
 
 
460 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  21.68 
 
 
460 aa  87.4  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.94 
 
 
474 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0477575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.73 
 
 
474 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.94 
 
 
474 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  21.68 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.2 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  21.06 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  23.23 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3378  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  32.64 
 
 
167 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.477381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1755  beta-glucosides PTS, EIIBCA  33.97 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000638137  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1959  PTS system, IIABC components  34.25 
 
 
727 aa  84.3  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00659457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  21.06 
 
 
460 aa  84.3  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  21.06 
 
 
479 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  21.06 
 
 
479 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  21.06 
 
 
460 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  21.06 
 
 
460 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  21.06 
 
 
479 aa  83.6  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2323  PTS system, beta-glucoside-specific IIABC subunit  33.33 
 
 
621 aa  83.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3509  PTS system, glucose subfamily, IIA subunit  32.64 
 
 
164 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>