More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1524 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 
517 aa  1046    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
585 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  32.7 
 
 
551 aa  166  9e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.69 
 
 
587 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  31.83 
 
 
554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.41 
 
 
587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.41 
 
 
587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.41 
 
 
587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.41 
 
 
587 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  32.41 
 
 
587 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
582 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  32.41 
 
 
587 aa  163  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
581 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  39.37 
 
 
346 aa  162  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.41 
 
 
587 aa  160  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
587 aa  160  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.41 
 
 
587 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
412 aa  157  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  30.59 
 
 
565 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
615 aa  156  9e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 
412 aa  156  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
585 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
606 aa  154  5e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
354 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 
422 aa  153  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
815 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
489 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  39.09 
 
 
356 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  38.03 
 
 
357 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  36.82 
 
 
458 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0217  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
449 aa  150  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.217538 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
600 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
458 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
458 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
571 aa  148  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
587 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
458 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  35.91 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1963  sensor histidine kinase  38.03 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  37.85 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
592 aa  147  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  39.35 
 
 
357 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  35.45 
 
 
458 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  35.45 
 
 
458 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  33.97 
 
 
437 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1287  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
468 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1435  phosphate regulon sensor protein PhoR  34.98 
 
 
442 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
442 aa  145  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  35.35 
 
 
458 aa  144  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
437 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 
458 aa  143  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2042  sensor histidine kinase  38.89 
 
 
351 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
597 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  34.43 
 
 
598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  30.53 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  36.44 
 
 
508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2063  sensor histidine kinase  38.43 
 
 
357 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000411382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
376 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 
589 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
584 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
584 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  34.26 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1373  histidine kinase  28.2 
 
 
541 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000714338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  38.43 
 
 
253 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 
376 aa  140  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  38.43 
 
 
347 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
607 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  37.21 
 
 
351 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3738  histidine kinase  26.22 
 
 
601 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018214  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
596 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
468 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0588  Signal transduction histidine kinase  35 
 
 
326 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  35.04 
 
 
584 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  34.88 
 
 
470 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  37.96 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  37.96 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  35.02 
 
 
422 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
571 aa  137  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  34.45 
 
 
591 aa  137  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
639 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
423 aa  137  5e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
442 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0175  histidine kinase  39.19 
 
 
231 aa  137  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
639 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2632  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
454 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.434659  normal  0.0783763 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
896 aa  136  8e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
460 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 
458 aa  136  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1492  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 
465 aa  136  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
444 aa  136  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  36.36 
 
 
571 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 
701 aa  136  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>