More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1348 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1348  arabinose efflux permease  100 
 
 		 381 aa  741    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0715454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2528  multidrug resistance protein  30.56 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  29.52 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2183  multidrug resistance protein  30.21 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.532431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2222  multidrug resistance protein  29.46 
 
 		 398 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1862  multidrug resistance protein  26.9 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2004  multidrug resistance protein  26.9 
 
 		 391 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2117  putative multidrug resistance protein  26.68 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.521892  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2038  putative multidrug resistance protein  27.59 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3423e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1832  multidrug resistance protein  27.59 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.71931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1816  permease; multidrug resistance protein  26.59 
 
 		 391 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.985624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2006  putative multidrug resistance protein  26.65 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3303  putative multidrug resistance protein  28.4 
 
 		 391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  29.38 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0077  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 398 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0085  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2232  major facilitator superfamily protein  27.3 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.165847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  26.3 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3708  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  27.15 
 
 		 404 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4004  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 391 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 391 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  26.55 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  27.72 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 390 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  26.97 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  26.7 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002192  putative MFS transporter  23.8 
 
 		 385 aa  96.7  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0137434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 404 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 404 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 404 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 404 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 394 aa  96.3  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 317 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  27.88 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 422 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4278  major facilitator family transporter  29.24 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  27.2 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 388 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.5 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  27.88 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  28.13 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 409 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  28.13 
 
 		 391 aa  93.2  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  25.34 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3422  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.93184  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  27.15 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1996  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.566259  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  27.15 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  28.13 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  26.37 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  25.99 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0239  hypothetical protein  26.29 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  28.14 
 
 		 430 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2421  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 384 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5394  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326407  normal  0.243711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>