180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0788 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0788  signal protein  100 
 
 		 654 aa  1340    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0653759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2141  DHH family protein  42.97 
 
 		 660 aa  529  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.195838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1977  signal protein  42.64 
 
 		 654 aa  529  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.152853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5621  DHH subfamily 1 protein  34.32 
 
 		 657 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000144841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5323  DHH subfamily 1 protein  34.32 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5151  DHH family phosphoesterase  34.32 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00172819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5580  DHH subfamily 1 protein  34.32 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33995e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5167  DHH family phosphoesterase  34.32 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5719  DHH subfamily 1 protein  34.32 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5658  DHH subfamily 1 protein  34.32 
 
 		 657 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000148947  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0010  phosphoesterase domain-containing protein  33.79 
 
 		 672 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0144039  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5597  DHH subfamily 1 protein  34.17 
 
 		 657 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0188603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5263  diguanylate cyclase and phosphoesterase  34.48 
 
 		 657 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5338  DHH subfamily 1 protein  34.17 
 
 		 657 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00027618  hitchhiker  0.000000025759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3413  diguanylate cyclase and phosphoesterase  34.88 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4010  diguanylate cyclase and phosphoesterase  34.47 
 
 		 657 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.874769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3542  diguanylate cyclase and phosphoesterase  35.2 
 
 		 658 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0011  signal protein  34.02 
 
 		 672 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00560638  hitchhiker  0.0000000733083 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1967  signal protein  32.58 
 
 		 675 aa  362  1e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.764897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2539  DHH family protein  31.32 
 
 		 655 aa  337  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0013  signal protein  33.08 
 
 		 685 aa  336  7e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0014  hypothetical protein  31.06 
 
 		 655 aa  335  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0014  phosphoesterase domain-containing protein  31.06 
 
 		 655 aa  335  2e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2258  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.26 
 
 		 669 aa  294  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0125063  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0080  phosphoesterase RecJ domain protein  30.86 
 
 		 667 aa  272  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.609068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0880  phosphoesterase RecJ domain protein  29.24 
 
 		 667 aa  271  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.631011  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0533  phosphoesterase RecJ domain protein  30.21 
 
 		 669 aa  257  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2973  DHH family protein  31.71 
 
 		 652 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2651  DHH family protein  31.71 
 
 		 652 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0151664  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3758  phosphoesterase domain-containing protein  30.63 
 
 		 684 aa  243  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf692  hypothetical protein  26.16 
 
 		 653 aa  164  6e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1458  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.62 
 
 		 892 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.402567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  23.26 
 
 		 330 aa  73.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  27.51 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  23.88 
 
 		 344 aa  70.5  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  24.62 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12852  hypothetical protein  25.59 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  24.12 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  24.84 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  26.86 
 
 		 486 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  25.27 
 
 		 352 aa  66.2  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  25.49 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl488  exopolyphosphatase-like  24.68 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2084  phosphoesterase, RecJ-like protein  24.58 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2130  phosphoesterase domain-containing protein  24.58 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480237  normal  0.0265519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2067  phosphoesterase domain-containing protein  24.58 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0130245  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  23.77 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1297  TrkA domain-containing protein  26.06 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.97662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  26.24 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  24.63 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3049  phosphoesterase RecJ domain protein  25.15 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.1164 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1433  polynucleotide adenylyltransferase region  27.27 
 
 		 904 aa  63.9  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.743333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1972  CBS  27.98 
 
 		 898 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.03578  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  25.57 
 
 		 909 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.32 
 
 		 821 aa  63.2  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0358  CBS domain containing protein  26.56 
 
 		 1077 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0457131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  23.05 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2316  phosphoesterase domain-containing protein  24.78 
 
 		 335 aa  62  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0324  phosphoesterase RecJ domain protein  25.16 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.988829  normal  0.0678816 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0531  phosphoesterase domain-containing protein  24.57 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.632858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  22.26 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2618  phosphoesterase RecJ domain protein  23.75 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  23.77 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  25.54 
 
 		 880 aa  60.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2844  phosphoesterase RecJ domain protein  26.5 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4037  phosphoesterase domain-containing protein  24.83 
 
 		 301 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.458843 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  23.65 
 
 		 334 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  23.32 
 
 		 890 aa  60.1  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2163  phosphoesterase RecJ domain protein  24.93 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.790144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5831  phosphoesterase RecJ domain protein  23.43 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0452248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  23.37 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  21.99 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  23.2 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  23.15 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0146  phosphoesterase RecJ domain protein  25.3 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00331466 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  22.97 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  23.01 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  24.85 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  23.15 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  27.23 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  25.45 
 
 		 875 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  21.96 
 
 		 325 aa  57  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  21.75 
 
 		 335 aa  57  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  24.56 
 
 		 334 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  22.19 
 
 		 330 aa  56.2  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  24.92 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2030  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.92 
 
 		 854 aa  55.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.609547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  24 
 
 		 353 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  23.91 
 
 		 329 aa  55.5  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  27 
 
 		 331 aa  55.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0777  hypothetical protein  23.58 
 
 		 307 aa  55.1  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  20.78 
 
 		 313 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  20.78 
 
 		 313 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3291  phosphoesterase domain-containing protein  23.23 
 
 		 310 aa  54.7  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0187  phosphoesterase RecJ domain protein  23.18 
 
 		 391 aa  54.3  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0537  DHH family protein  24.85 
 
 		 311 aa  54.3  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000764384  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3120  phosphoesterase RecJ domain protein  25.34 
 
 		 374 aa  53.9  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  26.85 
 
 		 888 aa  53.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0265  phosphoesterase domain-containing protein  21.32 
 
 		 332 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>