More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20130 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  100 
 
 		 76 aa  155  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  62.82 
 
 		 78 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 77 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  56.76 
 
 		 75 aa  86.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  61.19 
 
 		 79 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  47.22 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  48.1 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 835 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 711 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 		 801 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 1021 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 1021 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 824 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 832 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  38.57 
 
 		 817 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  45.9 
 
 		 826 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 830 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 814 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 1013 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  43.94 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  40 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 1040 aa  57  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  44.64 
 
 		 71 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 832 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 827 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 800 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 841 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 763 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 1182 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  40.91 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  40.91 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 841 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 827 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  39.68 
 
 		 751 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  40.91 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  36.92 
 
 		 792 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  42.42 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  42.42 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  42.42 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  42.42 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 732 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 797 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  42.42 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 724 aa  55.5  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40.62 
 
 		 833 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 946 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 821 aa  54.3  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 759 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 750 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 841 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 751 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3818  copper-translocating P-type ATPase  46.55 
 
 		 747 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.585028  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 790 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 737 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 739 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 737 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 737 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 789 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  40.91 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 839 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 838 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 836 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 		 937 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  37.7 
 
 		 792 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  31.82 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 872 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2317  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 829 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 		 762 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 759 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 759 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  40.79 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  35.94 
 
 		 560 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 		 836 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 816 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  34.78 
 
 		 761 aa  52  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 813 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 833 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 		 767 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 		 762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 		 762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 971 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  32.88 
 
 		 813 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 831 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  36 
 
 		 762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  40.32 
 
 		 826 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 799 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 732 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1150  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 66 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455128  hitchhiker  0.000000264701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 		 868 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 938 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 795 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 		 731 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>