72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4675 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4675  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  430  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194004  normal  0.0151968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04005  hypothetical protein  34.36 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0161  hypothetical protein  31.63 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.22168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3743  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.99 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.0133662 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3717  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.32 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0339005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2806  hypothetical protein  36.13 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0114125  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0183  hypothetical protein  32.09 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5237  hypothetical protein  30.81 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3045  hypothetical protein  33.66 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0241771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2112  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 750 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0756  HAD family hydrolase  22.17 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.453286  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0833  HAD family hydrolase  22.17 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.467298  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6135  HAD family hydrolase  41.76 
 
 		 294 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06538  hypothetical protein  24.04 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10516  phosphoserine phosphatase serB1  32.75 
 
 		 373 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3161  HAD family hydrolase  25.91 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2800  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  29.06 
 
 		 275 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283353 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0843  HAD family hydrolase  32.74 
 
 		 301 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163877  normal  0.772835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2772  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2835  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290746  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5286  HAD-superfamily hydrolase  28.17 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2812  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.292874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2731  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2947  hypothetical protein  31.07 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3795  hypothetical protein  29.95 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.670206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4844  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2276  HAD family hydrolase  31.4 
 
 		 819 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000198235  hitchhiker  0.000271662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0418  HAD family hydrolase  34.43 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0481  HAD family hydrolase  37.36 
 
 		 295 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0318  HAD family hydrolase  26.32 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2713  hypothetical protein  29.47 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2845  hypothetical protein  29.47 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1117  hypothetical protein  29.47 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02418  hypothetical protein  29.47 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2927  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.16 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2925  hypothetical protein  29.47 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0255  HAD-superfamily hydrolase  29.47 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2713  hypothetical protein  29.47 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1108  HAD superfamily (subfamily IF) hydrolase, YfhB  29.47 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0069  HAD family hydrolase  30.8 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0248353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0614  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  33.16 
 
 		 255 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4170  HAD family hydrolase  30.2 
 
 		 787 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243579  normal  0.356217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4432  HAD family hydrolase  29.66 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49620  phosphoserine phosphatase  31.43 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2102  HAD family hydrolase  27.44 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0362  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 289 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00108694  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5147  HAD superfamily hydrolase  32.71 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.416091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2746  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2664  HAD family hydrolase  26.73 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5054  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3228  HAD family hydrolase  25.87 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5379  HAD family hydrolase  27.23 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396939  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1100  HAD family hydrolase  25.47 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04380  hypothetical protein  32.41 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2224  HAD family hydrolase  28.24 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0346  XRE family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.923957  normal  0.0904875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3483  hypothetical protein  21.83 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.129655  normal  0.0813379 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0916  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  34.45 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1998  HAD family hydrolase  26.26 
 
 		 799 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5200  HAD family hydrolase  31.78 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0674  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 300 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0274  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  32.71 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0833  HAD family hydrolase  30.36 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0687  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 300 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.164292 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0667  HAD family hydrolase  30.97 
 
 		 300 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0348  HAD family hydrolase  33.02 
 
 		 290 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4446  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.11 
 
 		 290 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0428  hypothetical protein  31.48 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1925  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  28.46 
 
 		 273 aa  42  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0542  Phosphoserine phosphatase-like protein  33.33 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.260991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2722  HAD family hydrolase  35.34 
 
 		 305 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1316  HAD family hydrolase  27.57 
 
 		 241 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.021557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>