More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3918 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3918  flavoprotein disulfide reductase  100 
 
 
479 aa  946    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3517  flavoprotein disulfide reductase  67.89 
 
 
465 aa  591  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0548483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2932  flavoprotein disulfide reductase  67.18 
 
 
491 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.316087  hitchhiker  0.00133507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1285  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.22 
 
 
464 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1263  flavoprotein disulfide reductase  65.34 
 
 
478 aa  567  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184543  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0689  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  64 
 
 
463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3950  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  63.77 
 
 
481 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4180  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  64.67 
 
 
460 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112992  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25570  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  65.11 
 
 
495 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.302266  normal  0.390053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2559  flavoprotein disulfide reductase  64.07 
 
 
460 aa  548  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.226761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0696  flavoprotein disulfide reductase  60.12 
 
 
493 aa  551  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0836  flavoprotein disulfide reductase  63.14 
 
 
491 aa  551  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.801746  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1309  flavoprotein disulfide reductase  63.91 
 
 
471 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000251684 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5930  flavoprotein disulfide reductase  62.79 
 
 
483 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0274379  hitchhiker  0.00581278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0806  flavoprotein disulfide reductase  64.16 
 
 
471 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05640  flavoprotein disulfide reductase  61.23 
 
 
476 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1007  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  66.23 
 
 
480 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0782  flavoprotein disulfide reductase  60.13 
 
 
470 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00538135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0837  flavoprotein disulfide reductase  59.83 
 
 
467 aa  526  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.0144573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21170  flavoprotein disulfide reductase  61.42 
 
 
468 aa  522  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320231  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05750  flavoprotein disulfide reductase  59.45 
 
 
467 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1032  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  62.23 
 
 
506 aa  520  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.639755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1360  flavoprotein disulfide reductase  58.97 
 
 
468 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.538341  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0989  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  58.6 
 
 
467 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6404  flavoprotein disulfide reductase  59.19 
 
 
467 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4370  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  59.91 
 
 
467 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0394  flavoprotein disulfide reductase  61.54 
 
 
463 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0779  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  56.56 
 
 
463 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08180  flavoprotein disulfide reductase  60.75 
 
 
478 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.234528  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1792  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  57.26 
 
 
467 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4822  flavoprotein disulfide reductase  55.58 
 
 
471 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.756174  normal  0.061332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1249  flavoprotein disulfide reductase  54.8 
 
 
470 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1266  flavoprotein disulfide reductase  54.8 
 
 
470 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.781726 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1619  flavoprotein disulfide reductase  55.16 
 
 
495 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146678  normal  0.0187894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1276  flavoprotein disulfide reductase  54.58 
 
 
470 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.304931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13332  flavoprotein disulfide reductase  54.35 
 
 
471 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.49 
 
 
470 aa  243  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.37 
 
 
471 aa  243  7e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
468 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.63 
 
 
458 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.65 
 
 
458 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.67 
 
 
459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.56 
 
 
474 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.34 
 
 
465 aa  233  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.93 
 
 
465 aa  230  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.63 
 
 
473 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.53 
 
 
462 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.97 
 
 
465 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.62 
 
 
465 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.53 
 
 
470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.91 
 
 
468 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.37 
 
 
470 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.61 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.02 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
464 aa  220  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
467 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.83 
 
 
465 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.9 
 
 
466 aa  219  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.87 
 
 
464 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 
462 aa  218  2e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  32.97 
 
 
462 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.58 
 
 
480 aa  217  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
464 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.53 
 
 
459 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.53 
 
 
459 aa  216  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.89 
 
 
466 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
468 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.37 
 
 
459 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.34 
 
 
562 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.53 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.68 
 
 
467 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.47 
 
 
466 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 
468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.75 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.36 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.69 
 
 
470 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.97 
 
 
464 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.26 
 
 
461 aa  213  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.33 
 
 
470 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.53 
 
 
491 aa  213  7.999999999999999e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
484 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.05 
 
 
484 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.19 
 
 
465 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.4 
 
 
472 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 
459 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.66 
 
 
468 aa  211  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.87 
 
 
468 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.43 
 
 
466 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
484 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.44 
 
 
465 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.98 
 
 
464 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.87 
 
 
468 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.97 
 
 
465 aa  211  3e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.81 
 
 
467 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 
463 aa  210  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>