126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3526 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3526  transcription factor WhiB  100 
 
 		 110 aa  212  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000325295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27540  Transcription factor WhiB-like protein  52.43 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7795  transcription factor WhiB  63.01 
 
 		 113 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.360781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1770  transcription factor WhiB  51.58 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1587  transcription factor WhiB  52.7 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00114903  normal  0.301074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3740  transcription factor WhiB  66.13 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0269077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13219  transcriptional regulatory protein whib-like whiB7  52.5 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.448854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1181  transcription factor WhiB  46.32 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0532  putative DNA-binding protein  64.52 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0936  transcription factor WhiB  48.81 
 
 		 109 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000309133  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1517  transcription factor WhiB  59.68 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.522616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0788  transcription factor WhiB  60.66 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2963  transcription factor WhiB  63.16 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.21124  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11410  Transcription factor WhiB-like protein  52.63 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.909585  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3737  transcription factor WhiB  51.47 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0174753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3790  transcription factor WhiB  48.68 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449427  normal  0.631294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4118  transcription factor WhiB  52.46 
 
 		 120 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  normal  0.282654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8356  hypothetical protein  54.02 
 
 		 89 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438015  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19130  Transcription factor WhiB  57.89 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.1144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4384  transcription factor WhiB  46.77 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1410  transcription factor WhiB  54.69 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1428  transcription factor WhiB  54.69 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.52297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1464  transcription factor WhiB  54.69 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07550  Transcription factor WhiB-like protein  56.67 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.873436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0929  transcription factor WhiB  42.7 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3804  transcription factor WhiB  58.06 
 
 		 92 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.758516  normal  0.020426 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3044  transcription factor WhiB  50.82 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.539558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3493  transcription factor WhiB  46.77 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.158486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4659  transcription factor WhiB  49.18 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0717  transcription factor WhiB  47.54 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1809  transcription factor WhiB  46.77 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4230  transcription factor WhiB  55 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  40 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  44.83 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26270  transcription factor WhiB  53.06 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  42.42 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  40 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08530  transcription factor WhiB  45.61 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.590298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  46.43 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5864  transcription factor WhiB  46.43 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0507295  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1206  transcription factor WhiB  39.74 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.56216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  44.12 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0947  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0110  putative regulatory protein  48.98 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  45.28 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  46.94 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  45.28 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0566  transcription factor WhiB  41.18 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  39.68 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  39.68 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  39.68 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4303  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.956694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0196  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.838219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36240  transcription factor WhiB  48 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  45.28 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4353  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4795  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0837605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0327  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  39.06 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5240  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231068  hitchhiker  0.000573048 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4278  transcription factor WhiB  38.71 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.212207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  36.67 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  44.9 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  41.79 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4922  transcription factor WhiB  32.94 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  48.98 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0336  transcription factor WhiB  38.71 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  35.51 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1861  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.254853  hitchhiker  0.00875656 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  43.4 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  43.1 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  42.86 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05270  Transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 176 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.463527  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  49.02 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3098  transcription factor WhiB  48.94 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.918982  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2151  transcription factor WhiB  34.55 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.133785  normal  0.062775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2291  transcription factor WhiB  34.55 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  40.62 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  44.9 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  40.62 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1741  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0449249  normal  0.98439 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>