35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0990 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0990  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 465 aa  878    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0126983  normal  0.0861739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  46.44 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0372  protein of unknown function DUF1212  43.94 
 
 		 464 aa  236  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19250  hypothetical protein  36.5 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0275947  hitchhiker  0.00598211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13769  transmembrane protein  38.23 
 
 		 529 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35040  hypothetical protein  37.09 
 
 		 510 aa  203  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  36.96 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0954  hypothetical protein  39.02 
 
 		 555 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.190534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5838  hypothetical protein  36.07 
 
 		 529 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3700  hypothetical protein  39.19 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.296209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0810  protein of unknown function DUF1212  35.49 
 
 		 474 aa  176  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3988  hypothetical protein  36.93 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.911951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3914  hypothetical protein  36.93 
 
 		 531 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.631878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3929  hypothetical protein  36.7 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0854628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  31.55 
 
 		 461 aa  139  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  30 
 
 		 498 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  31.28 
 
 		 468 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24060  hypothetical protein  32.24 
 
 		 497 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.214274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  30.61 
 
 		 511 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  33.18 
 
 		 475 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  32.52 
 
 		 448 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  33.5 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  29.26 
 
 		 634 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  22.59 
 
 		 256 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.01 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0822  protein of unknown function DUF1212  25.76 
 
 		 250 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000371019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  37.89 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1520  protein of unknown function DUF1212  23.95 
 
 		 251 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  26.27 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  25 
 
 		 200 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  26.23 
 
 		 158 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1897  hypothetical protein  25.68 
 
 		 173 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2186  hypothetical protein  25.68 
 
 		 173 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  21.64 
 
 		 164 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  22.66 
 
 		 252 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>