More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0865 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  63.71 
 
 
546 aa  651    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  63.92 
 
 
546 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  63.71 
 
 
546 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  63.71 
 
 
546 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  63.75 
 
 
529 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  100 
 
 
551 aa  1140    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  63.92 
 
 
546 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  62.96 
 
 
529 aa  641    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  78 
 
 
552 aa  884    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  63.09 
 
 
529 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  78.1 
 
 
554 aa  886    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  61.44 
 
 
529 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  77.44 
 
 
555 aa  867    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  66.33 
 
 
543 aa  677    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  77.74 
 
 
552 aa  889    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  63.86 
 
 
546 aa  649    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  62.38 
 
 
530 aa  640    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  62.38 
 
 
530 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2900  Catalase  62.91 
 
 
550 aa  656    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  50.92 
 
 
488 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  50.92 
 
 
488 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  50.92 
 
 
488 aa  486  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  50.92 
 
 
488 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  50.92 
 
 
488 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  50.92 
 
 
488 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  49.9 
 
 
488 aa  479  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  50.1 
 
 
488 aa  478  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  50.31 
 
 
488 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  50.51 
 
 
488 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  52.08 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  47.92 
 
 
504 aa  431  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  47.25 
 
 
505 aa  427  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  45.45 
 
 
479 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  45.25 
 
 
479 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  45.45 
 
 
479 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  46.43 
 
 
489 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  46.44 
 
 
705 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  45.47 
 
 
485 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  44.92 
 
 
705 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  43.81 
 
 
689 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  46.06 
 
 
704 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  46.05 
 
 
705 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  44.44 
 
 
710 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  44.81 
 
 
735 aa  413  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  48.38 
 
 
516 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  48.38 
 
 
505 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  48.38 
 
 
511 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  44.49 
 
 
484 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  48.38 
 
 
511 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  48.38 
 
 
511 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  45.89 
 
 
808 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  44.54 
 
 
479 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  43.8 
 
 
481 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  46.49 
 
 
701 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  43.09 
 
 
794 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  46.52 
 
 
702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  43.12 
 
 
700 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  45.29 
 
 
705 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  43.03 
 
 
713 aa  408  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  46.52 
 
 
702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  43.89 
 
 
705 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  43.07 
 
 
718 aa  403  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2441  catalase  44.26 
 
 
481 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.431026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  46.11 
 
 
498 aa  405  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0280  hydroperoxidase II  43.87 
 
 
716 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2070  hydroperoxidase II  42.7 
 
 
751 aa  402  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.192326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  44.11 
 
 
693 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  45.1 
 
 
799 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1801  Catalase  44.4 
 
 
496 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  44.51 
 
 
848 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06580  catalase  44.49 
 
 
504 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  45.51 
 
 
509 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  45.26 
 
 
728 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  45.24 
 
 
694 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  44.9 
 
 
728 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  43.44 
 
 
688 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05192  catalase  45.25 
 
 
478 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001311  catalase  45.45 
 
 
479 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1721  catalase  44.62 
 
 
487 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1836  catalase  44.4 
 
 
695 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.027384  unclonable  0.00000000096312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  45.73 
 
 
720 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4346  Catalase  43.98 
 
 
716 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.202786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3881  catalase  44.26 
 
 
480 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000327701  hitchhiker  0.000000338063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  45.64 
 
 
510 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0064  hydroperoxidase II  45.02 
 
 
713 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4342  catalase  44.55 
 
 
695 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.631099  normal  0.0151111 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  44.9 
 
 
704 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  43.52 
 
 
567 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  45.34 
 
 
507 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  44.49 
 
 
709 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  42.93 
 
 
701 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.247073 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4611  catalase  46.08 
 
 
710 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1242  Catalase  45.36 
 
 
480 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  43.78 
 
 
709 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5263  catalase  42.08 
 
 
716 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1107  catalase  43.74 
 
 
536 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.610456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21110  catalase  44.35 
 
 
487 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09150  catalase  43.99 
 
 
482 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.789625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  43.04 
 
 
718 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3018  catalase  44.63 
 
 
485 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>