More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2509 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2509  aminotransferase class I and II  100 
 
 
385 aa  768    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12317  aminotransferase  40.39 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0099  aminotransferase class I and II  43.6 
 
 
384 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2784  aminotransferase class I and II  41.77 
 
 
421 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2586  aminotransferase, class I and II  41.56 
 
 
415 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2967  aminotransferase class I and II  42.2 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0077692  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14610  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  38.97 
 
 
386 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.427424  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3143  aminotransferase  39.19 
 
 
381 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.29788 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0562  aminotransferase class I and II  34.34 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4791  aminotransferase class I and II  38.86 
 
 
383 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.084059  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10075  aminotransferase  36.55 
 
 
390 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.8846  normal  0.0279685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2696  aminotransferase, class I and II  33.5 
 
 
395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  30.08 
 
 
390 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1786  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
386 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  30.51 
 
 
390 aa  175  9e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4578  aminotransferase, class I and II  37.05 
 
 
386 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.764552  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3736  aminotransferase, class I and II  30.13 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2643  aminotransferase, class I and II  28.89 
 
 
514 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  30.3 
 
 
383 aa  169  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6332  aminotransferase class I and II  35.19 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000717264  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  31.59 
 
 
392 aa  160  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  30.24 
 
 
397 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  34.08 
 
 
393 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  28.97 
 
 
386 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  28.86 
 
 
393 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  31.47 
 
 
385 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  28.91 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  28.64 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  28.91 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  30.36 
 
 
385 aa  153  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2428  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
370 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.592718 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  31.22 
 
 
394 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  30.17 
 
 
392 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  30.17 
 
 
392 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3169  aminotransferase class I and II  30.14 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.129475 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  29.01 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  29.29 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0781  aminotransferase, class I and II  31.03 
 
 
414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.473156  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  29.07 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1601  bifunctional PLP-dependent enzyme  29.1 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  31.78 
 
 
385 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0412  aminotransferase class I and II  28.64 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0696  aminotransferase class I and II  32.15 
 
 
385 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  29.25 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  28.87 
 
 
391 aa  146  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  30.16 
 
 
391 aa  146  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  28.35 
 
 
400 aa  145  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0465  aminotransferase, class I and II  31.02 
 
 
389 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  28.5 
 
 
390 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2789  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 
383 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.232198 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  29.74 
 
 
393 aa  143  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  24.74 
 
 
383 aa  142  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  28.06 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3079  aminotransferase class I and II  32.41 
 
 
394 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171547  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  30.37 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  26.41 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  28.84 
 
 
393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  26.79 
 
 
390 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  25.44 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  28.84 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  24.74 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  30.81 
 
 
396 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  26.67 
 
 
372 aa  139  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  24.81 
 
 
383 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  26.6 
 
 
379 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  24.48 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  28.24 
 
 
401 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  26.91 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  24.48 
 
 
383 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1998  aminotransferase, class I and II  30.13 
 
 
383 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.575791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  29.68 
 
 
386 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  31.23 
 
 
405 aa  135  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  28.72 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0648  aminotransferase, class I and II  32.1 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756968  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  24.3 
 
 
383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  24.23 
 
 
383 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  24.23 
 
 
383 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  23.97 
 
 
386 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1423  aminotransferase class I and II  29.73 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0240622  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  26.74 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  28.17 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0178  aminotransferase class I and II  29.63 
 
 
390 aa  129  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0609129  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  25.19 
 
 
387 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  31.98 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  26.36 
 
 
389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  23.97 
 
 
383 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  23.45 
 
 
383 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  27.34 
 
 
384 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  25.95 
 
 
398 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  28.32 
 
 
387 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  27.88 
 
 
393 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  25.74 
 
 
390 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  25.59 
 
 
399 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  25.67 
 
 
393 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  24.23 
 
 
383 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  27.96 
 
 
396 aa  123  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  29.5 
 
 
390 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01594  Aminotransferase, class I and II  28.17 
 
 
391 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0792  aminotransferase  21.53 
 
 
396 aa  120  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.108928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>