More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1785 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1785  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 361 aa  724    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09920  peptide chain release factor 1  83.67 
 
 		 361 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1286  peptide chain release factor 1  77.81 
 
 		 373 aa  534  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.258232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2459  peptide chain release factor 1  75.68 
 
 		 366 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2352  peptide chain release factor 1  70.03 
 
 		 357 aa  511  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000547652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2619  peptide chain release factor 1  70.03 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.254824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1205  peptide chain release factor 1  68.26 
 
 		 356 aa  501  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1751  peptide chain release factor 1  67.8 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1656  peptide chain release factor 1  68.38 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2419  peptide chain release factor 1  68.47 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.922635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0324  peptide chain release factor 1  66.48 
 
 		 356 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119961 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1086  peptide chain release factor 1  62.64 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4148  peptide chain release factor 1  69.05 
 
 		 363 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1061  peptide chain release factor 1  79.3 
 
 		 392 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.742793  normal  0.892078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0641  peptide chain release factor 1  69.19 
 
 		 364 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3931  peptide chain release factor 1  68.84 
 
 		 361 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.337468  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0888  peptide chain release factor 1  68.09 
 
 		 350 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.255714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1257  peptide chain release factor 1  73.45 
 
 		 355 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626202  normal  0.01526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2101  peptide chain release factor 1  67.23 
 
 		 361 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015284  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6150  peptide chain release factor 1  63.28 
 
 		 354 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.749977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1889  peptide chain release factor 1  61.3 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.640153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1010  peptide chain release factor 1  64.94 
 
 		 356 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3720  peptide chain release factor 1  66.67 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3961  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3887  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3873  peptide chain release factor 1  59.55 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29910  peptide chain release factor 1  65.62 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.363268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1304  peptide chain release factor 1  64.1 
 
 		 367 aa  429  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11326  peptide chain release factor 1  58.43 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08070  peptide chain release factor 1  65.64 
 
 		 369 aa  426  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4339  peptide chain release factor 1  58.71 
 
 		 357 aa  418  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776399 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1236  peptide chain release factor 1  60 
 
 		 362 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.417509  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4026  peptide chain release factor 1  66.07 
 
 		 362 aa  411  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000605474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3644  peptide chain release factor 1  62.65 
 
 		 362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1909  peptide chain release factor 1  61.06 
 
 		 364 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2307  peptide chain release factor 1  59.88 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.822119 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18340  peptide chain release factor 1  61.32 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19240  peptide chain release factor 1  60.06 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3170  peptide chain release factor 1  49.31 
 
 		 356 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000384415  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2083  peptide chain release factor 1  48.9 
 
 		 356 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2154  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 355 aa  338  9e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000509235  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1654  peptide chain release factor 1  50.43 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2466  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000799175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2176  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.00000000328118  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0821  peptide chain release factor 1  48.18 
 
 		 357 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.16719  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0451  peptide chain release factor 1  49.28 
 
 		 357 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4833  peptide chain release factor 1  48.86 
 
 		 355 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2872  peptide chain release factor 1 (bRF-1)  47.59 
 
 		 357 aa  335  9e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416881  hitchhiker  0.000000000305481 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2791  peptide chain release factor 1  46.49 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0702  peptide chain release factor 1  46.93 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.759041 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3322  peptide chain release factor 1  47.79 
 
 		 358 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000442042  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2397  peptide chain release factor 1  49 
 
 		 355 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000706535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0414  peptide chain release factor 1  45.21 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000401474  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3645  peptide chain release factor 1  48.61 
 
 		 361 aa  329  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2397  peptide chain release factor 1  48.88 
 
 		 356 aa  328  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.456174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3126  peptide chain release factor 1  45.96 
 
 		 361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000819953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0063  peptide chain release factor 1  49.86 
 
 		 355 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000318273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5500  peptide chain release factor 1  45.48 
 
 		 358 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000210571  unclonable  8.0628e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5178  peptide chain release factor 1  44.93 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000138678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5013  peptide chain release factor 1  44.93 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000402063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5029  peptide chain release factor 1  44.93 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5507  peptide chain release factor 1  44.93 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000104378  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0083  peptide chain release factor 1  47.09 
 
 		 357 aa  325  7e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5421  peptide chain release factor 1  44.93 
 
 		 358 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.8659e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5456  peptide chain release factor 1  45.75 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000128855  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0119  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5572  peptide chain release factor 1  45.75 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100734  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2064  peptide chain release factor 1  47.01 
 
 		 361 aa  324  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.243868  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3552  peptide chain release factor 1  44.11 
 
 		 362 aa  323  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0245342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5452  peptide chain release factor 1  44.66 
 
 		 358 aa  324  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000502201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3614  peptide chain release factor 1  47.47 
 
 		 363 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000815596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4213  peptide chain release factor 1  49.14 
 
 		 372 aa  322  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.42192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3850  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 		 355 aa  322  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000369919  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  44.2 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0436  peptide chain release factor 1  46.83 
 
 		 360 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6577  peptide chain release factor 1  47.81 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.940895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0482  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.464905 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2360  peptide chain release factor 1  46.78 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2595  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.324585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0510  peptide chain release factor 1  47.21 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3522  peptide chain release factor 1  46.56 
 
 		 360 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217548  normal  0.148888 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4472  peptide chain release factor 1  44.69 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3737  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1029  peptide chain release factor 1  46.8 
 
 		 355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5127  peptide chain release factor 1  45.75 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000488952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0472  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 356 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0696  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3546  peptide chain release factor 1  47.19 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00646422  hitchhiker  0.0000410243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2692  peptide chain release factor 1  46.53 
 
 		 356 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000179951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0380  peptide chain release factor 1  47.99 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.362441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1808  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 357 aa  319  6e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0394  peptide chain release factor 1  45.9 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.462298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0396  peptide chain release factor 1  45.9 
 
 		 370 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1652  peptide chain release factor 1  50.57 
 
 		 364 aa  317  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.534857  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0753  peptide chain release factor 1  45.45 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000176457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3104  peptide chain release factor 1  47.83 
 
 		 355 aa  317  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3597  peptide chain release factor 1  46.24 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0078  peptide chain release factor 1  46.59 
 
 		 357 aa  316  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2888  peptide chain release factor 1  46.37 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.362694 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1529  peptide chain release factor 1  49.3 
 
 		 361 aa  316  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>