More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0434 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 155 aa  300  7.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  75.48 
 
 		 157 aa  217  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  68.55 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  71.71 
 
 		 153 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  68.63 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  69.74 
 
 		 153 aa  200  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  71.71 
 
 		 152 aa  197  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  64.38 
 
 		 152 aa  187  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  65.07 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  69.59 
 
 		 152 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  74.15 
 
 		 152 aa  180  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  69.78 
 
 		 155 aa  176  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  66.01 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  68.21 
 
 		 166 aa  174  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  65.94 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  65.94 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  65.94 
 
 		 162 aa  173  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  60.4 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  72.79 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  55.33 
 
 		 156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  72.14 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  64.15 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  64.23 
 
 		 153 aa  171  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  64.96 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  64.43 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  53.38 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  65.99 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  61.94 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  65.73 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  69.48 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  68 
 
 		 167 aa  160  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  53.33 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  65 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  62.09 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  67.13 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 154 aa  153  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  54.36 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  56.46 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  67.81 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  63.7 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  50.67 
 
 		 154 aa  146  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  48.41 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  50.67 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  51.95 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3096  Endoribonuclease L-PSP  66.25 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000584514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 155 aa  143  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1285  Endoribonuclease L-PSP  55.13 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.770765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  48.67 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6537  endoribonuclease L-PSP  53.21 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21507  normal  0.550061 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  48.98 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0607  Endoribonuclease L-PSP  62.91 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.322518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  50.66 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  47.4 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  45.27 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  45.64 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  47.71 
 
 		 164 aa  137  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 155 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  48.37 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  48.37 
 
 		 155 aa  135  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  48.37 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  48.37 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  49.02 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  51.01 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  48.68 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  50.32 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  46.41 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  49.02 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1404  Endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  49.34 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  49.36 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  45.75 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0960  hypothetical protein  46.71 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.304597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  48.37 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2609  endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  48.34 
 
 		 152 aa  130  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0814  hypothetical protein  45.86 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.565462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>