36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3015 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  764    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  51.18 
 
 
1461 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  50.78 
 
 
214 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  50.39 
 
 
485 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3385  hypothetical protein  49.61 
 
 
324 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44526  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0413  hypothetical protein  40.8 
 
 
839 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.230778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  40.98 
 
 
237 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  39.34 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  38.71 
 
 
126 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  30.92 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  32.89 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01200  hypothetical protein  28.47 
 
 
363 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0611166  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  38.14 
 
 
119 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3380  hypothetical protein  41.77 
 
 
77 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0173  hypothetical protein  29.93 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  32.21 
 
 
1227 aa  56.6  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  39 
 
 
464 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  33.94 
 
 
430 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0540  hypothetical protein  26.63 
 
 
389 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  35.85 
 
 
130 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  36 
 
 
129 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2336  hypothetical protein  27.74 
 
 
361 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00444654  normal  0.017631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2437  hypothetical protein  28.57 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.015261  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  37 
 
 
129 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1161  hypothetical protein  35.58 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249167  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  35.05 
 
 
129 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  34.95 
 
 
556 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  35.05 
 
 
129 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  35.05 
 
 
129 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  35.05 
 
 
129 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  35.05 
 
 
129 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  35.05 
 
 
129 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  35.05 
 
 
129 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2760  hypothetical protein  34.34 
 
 
540 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.824403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  33.01 
 
 
119 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>