More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2237 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2237  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
355 aa  719    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201984  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1575  nitrogen regulation protein  67.9 
 
 
357 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0711174  normal  0.0291432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2837  nitrogen regulation protein, NtrB signal transduction histidine kinase  63.32 
 
 
368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1457  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  63.32 
 
 
368 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.291348 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  62.46 
 
 
368 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.785514 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1362  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  58.21 
 
 
362 aa  412  1e-114  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4130  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  50.84 
 
 
385 aa  319  5e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.16899  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3130  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.2 
 
 
371 aa  282  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0945514  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3046  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.47 
 
 
377 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2819  PAS sensor protein  43.47 
 
 
377 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.295885  normal  0.569504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2937  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.75 
 
 
381 aa  279  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0320992  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2862  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.81 
 
 
390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1836  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.86 
 
 
391 aa  272  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.058268  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2883  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.96 
 
 
389 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.703794  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2577  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.6 
 
 
390 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00911748  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1444  nitrogen regulation protein ntrB  41.88 
 
 
391 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2589  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.4 
 
 
390 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  0.0145748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2169  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.69 
 
 
380 aa  266  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.942916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4069  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.46 
 
 
395 aa  265  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.14 
 
 
367 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6538  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.14 
 
 
367 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1518  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.14 
 
 
391 aa  256  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0435216 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2071  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.76 
 
 
374 aa  255  8e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0183678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4400  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.62 
 
 
389 aa  255  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1076  nitrogen regulation protein NtrB  41.47 
 
 
380 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1118  nitrogen regulation protein NtrB  41.47 
 
 
367 aa  252  6e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2033  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.88 
 
 
381 aa  249  7e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.825681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1677  Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40 
 
 
366 aa  246  6e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.304521  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0528  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.92 
 
 
381 aa  245  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2134  two component sensor kinase  39.47 
 
 
381 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211649  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1811  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.72 
 
 
384 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659611 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1618  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.72 
 
 
384 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1089  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.75 
 
 
380 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1619  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.17 
 
 
377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0486  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.66 
 
 
369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0344418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2605  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.36 
 
 
376 aa  223  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0246  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.98 
 
 
373 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.1011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1276  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.43 
 
 
363 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317973  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1927  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.82 
 
 
373 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109087  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3671  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.24 
 
 
355 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.26 
 
 
358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.051036  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  33.43 
 
 
354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2542  nitrogen regulation protein NR(II)  37.77 
 
 
364 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  31.64 
 
 
348 aa  162  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.95 
 
 
346 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.18 
 
 
365 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4143  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
362 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3560  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.98 
 
 
351 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  32.35 
 
 
336 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2902  nitrogen regulation protein NR(II)  33.24 
 
 
361 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2520  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.24 
 
 
361 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5858  two-component sensor NtrB  29.34 
 
 
358 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67670  two-component sensor NtrB  29.34 
 
 
358 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5047  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.37 
 
 
361 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1441  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.75 
 
 
349 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0722715  hitchhiker  0.0000363452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4821  sensor histidine kinase  29.81 
 
 
361 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4922  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.37 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1845  nitrogen regulation protein  32.77 
 
 
395 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5100  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.37 
 
 
361 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0283  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.28 
 
 
346 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0340  Signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.75 
 
 
361 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0353  nitrogen regulation protein NtrB  29.53 
 
 
361 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0026  nitrogen regulation protein NR(II)  31 
 
 
349 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.968773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1523  putative nitrogen regulation, histidine kinase, protein NR(II)  32.78 
 
 
380 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000460807  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0028  nitrogen regulation protein NR(II)  31 
 
 
349 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3426  nitrogen regulation protein  30.95 
 
 
348 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4190  nitrogen regulation protein NR(II)  31 
 
 
349 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.497456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2614  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.68 
 
 
380 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.082338  normal  0.678018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5000  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.31 
 
 
358 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.65 
 
 
348 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.617913 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2166  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.11 
 
 
380 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.11 
 
 
380 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.516447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2148  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.11 
 
 
380 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0767  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.92 
 
 
374 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.84 
 
 
355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5457  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.02 
 
 
380 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4254  nitrogen regulation protein NR(II)  32.95 
 
 
349 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.388785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  30.99 
 
 
349 aa  153  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.89 
 
 
362 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4158  nitrogen regulation protein NR(II)  31.75 
 
 
349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2768  nitrogen regulation protein  32.4 
 
 
395 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1741  nitrogen regulation protein  32.4 
 
 
357 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.546015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1523  nitrogen regulation protein NR(II)  32.4 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2251  nitrogen regulation protein NR(II)  32.4 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3068  nitrogen regulation protein NR(II)  32.4 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2689  nitrogen regulation protein NR(II)  32.4 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2633  nitrogen regulation protein NR(II)  32.4 
 
 
380 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.90491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03754  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with GlnG  32.95 
 
 
349 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4117  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.95 
 
 
349 aa  152  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4391  nitrogen regulation protein NR(II)  32.95 
 
 
349 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.132536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.68 
 
 
393 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.25113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4096  nitrogen regulation protein NR(II)  32.95 
 
 
349 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0416  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30 
 
 
361 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.75 
 
 
345 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5315  nitrogen regulation protein NR(II)  32.95 
 
 
349 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.962522  normal  0.565649 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03703  hypothetical protein  32.95 
 
 
349 aa  152  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.17 
 
 
348 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.627159  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4147  nitrogen regulation protein NR(II)  32.95 
 
 
349 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  33.14 
 
 
363 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2501  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
363 aa  150  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>