More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1792 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.34557 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0923  tyrosyl-tRNA synthetase  73 
 
 		 417 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2151  tyrosyl-tRNA synthetase  72.31 
 
 		 417 aa  374  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1913  tyrosyl-tRNA synthetase  66.41 
 
 		 414 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.247685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1155  tyrosyl-tRNA synthetase  63.74 
 
 		 416 aa  334  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4041  tyrosyl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 416 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00764933  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0927  tyrosyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 416 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2032  tyrosyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 		 418 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1906  tyrosyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 418 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.543726  normal  0.0386015 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2113  tyrosyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 418 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569911  normal  0.0455725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2845  tyrosyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 418 aa  295  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.662141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 413 aa  292  3e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0905684  normal  0.181469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2738  tyrosyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 418 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.186886  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2452  tyrosyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 418 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2046  tyrosyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 418 aa  288  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1308  tyrosyl-tRNA synthetase  57.69 
 
 		 415 aa  287  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.589985  normal  0.597728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1473  tyrosyl-tRNA synthetase  53.82 
 
 		 417 aa  287  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal  0.0231492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1668  tyrosyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 417 aa  285  5e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.993205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2581  tyrosyl-tRNA synthetase  54.02 
 
 		 419 aa  283  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2998  tyrosyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 418 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.243953  normal  0.0659973 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0806  tyrosyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 		 417 aa  281  7.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.66983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2100  tyrosyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0674945  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4474  tyrosyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 416 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0726  tyrosyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 417 aa  279  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.343118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3960  tyrosyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 417 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2332  tyrosyl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 418 aa  276  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1785  tyrosyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 417 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.591619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2260  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 417 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0926  tyrosyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27323  predicted protein  49.63 
 
 		 488 aa  272  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1616  tyrosyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 419 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0920  tyrosyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 417 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0020  tyrosyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 421 aa  271  7e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3267  tyrosyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 416 aa  268  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.762137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1513  tyrosyl-tRNA synthetase  54.58 
 
 		 420 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.958797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0055  tyrosyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 		 418 aa  259  3e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1649  tyrosyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 422 aa  259  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2760  tyrosyl-tRNA synthetase  51.14 
 
 		 423 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0242462 
 
 
-
 
NC_002978  WD1115  tyrosyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 416 aa  258  5.0000000000000005e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5839  tyrosyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 426 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109224  normal  0.471863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1870  tyrosyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2987  tyrosyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 423 aa  248  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0091  tyrosyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 418 aa  248  7e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0698214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3213  tyrosyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 423 aa  248  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3171  tyrosyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 423 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0952  tyrosyl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 412 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10420  tyrosyl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 408 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0609  tyrosyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00990459  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0861  tyrosyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 406 aa  233  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 406 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0345  tyrosyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.388685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 410 aa  228  6e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 408 aa  223  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0619  tyrosyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 406 aa  221  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.171861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0633  tyrosyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 406 aa  221  9e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0281376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2577  tyrosyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 435 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000613291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 424 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0372  tyrosyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 405 aa  213  1.9999999999999998e-54  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1514  tyrosyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 416 aa  207  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000130469  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 430 aa  202  4e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  45.96 
 
 		 422 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 425 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1905  tyrosyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 428 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13251  normal  0.168807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1896  tyrosyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 428 aa  198  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1979  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 423 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 421 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119608  Tyrosyl-tRNA synthetase, probable  42.24 
 
 		 484 aa  195  8.000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0017  tyrosyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 434 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 447 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 432 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 426 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 418 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1624  tyrosyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 411 aa  192  6e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1071  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 448 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000119232  hitchhiker  0.000872394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 420 aa  192  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1511  tyrosyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 437 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000132583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 424 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1512  tyrosyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 437 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.675867  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 419 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 424 aa  188  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06520  tyrosyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 418 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0113  tyrosyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 432 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397659  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 418 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 418 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3020  tyrosyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 418 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 419 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 424 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>