More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1624 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1624  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 411 aa  816    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 425 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  48.41 
 
 		 422 aa  348  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1905  tyrosyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13251  normal  0.168807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 421 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3294  tyrosyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 419 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1896  tyrosyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06520  tyrosyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 419 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 421 aa  342  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  339  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  338  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  338  8e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 418 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 		 420 aa  336  3.9999999999999995e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 420 aa  333  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1507  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 427 aa  332  7.000000000000001e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0498725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0017  tyrosyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 434 aa  332  8e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5445  tyrosyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 427 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0550  tyrosyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 431 aa  331  2e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0723  tyrosyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 408 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.154159  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25540  tyrosyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000651  tyrosyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2338  tyrosyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000770628  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3513  tyrosyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 425 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2955  tyrosyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2999  tyrosyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2970  tyrosyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  0.024912 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1511  tyrosyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000132583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 432 aa  319  7e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 420 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1979  tyrosyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5462  tyrosyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0022197  hitchhiker  0.00568938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 419 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1336  tyrosyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.556286  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 419 aa  316  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 420 aa  315  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 420 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4446  tyrosyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 416 aa  315  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  0.300449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3153  tyrosyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 437 aa  314  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1815  tyrosyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 417 aa  314  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 420 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2362  tyrosyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.587755  decreased coverage  0.00168263 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1254  tyrosyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.166593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 		 422 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0169974  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21660  tyrosyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 422 aa  309  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0207964  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0587  hypothetical protein  40.52 
 
 		 427 aa  308  8e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2578  tyrosyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00252994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1512  tyrosyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 437 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.675867  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.523677 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  39.34 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14310  tyrosyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0115503  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0639  tyrosyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.529761  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3316  tyrosyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.355813 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2044  tyrosyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2081  tyrosyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 408 aa  302  6.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0336004  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0921  tyrosyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  302  7.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0622234  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1564  tyrosyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 425 aa  302  9e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3946  tyrosyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>