More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3020 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3020  tyrosyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  843    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2160  tyrosyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000761331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2021  tyrosyl-tRNA synthetase  59.91 
 
 		 421 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5462  tyrosyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0022197  hitchhiker  0.00568938 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1254  tyrosyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 		 426 aa  480  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.166593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2043  tyrosyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1120  tyrosyl-tRNA synthetase  57.04 
 
 		 422 aa  475  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6068  Tyrosine--tRNA ligase  58.16 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4122  tyrosyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 450 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00834024  hitchhiker  0.0000528667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1905  tyrosyl-tRNA synthetase  59.43 
 
 		 428 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13251  normal  0.168807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1979  tyrosyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 423 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0364525  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2362  tyrosyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 422 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.587755  decreased coverage  0.00168263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1896  tyrosyl-tRNA synthetase  58 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1511  tyrosyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 		 437 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000132583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22230  tyrosyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 420 aa  459  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1336  tyrosyl-tRNA synthetase  56.32 
 
 		 419 aa  456  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.556286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3040  tyrosyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4446  tyrosyl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  0.300449 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1512  tyrosyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.675867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3153  tyrosyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 422 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14310  tyrosyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 447 aa  441  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0115503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  55.21 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5445  tyrosyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 427 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3294  tyrosyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3513  tyrosyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25540  tyrosyl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2970  tyrosyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  0.024912 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2999  tyrosyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2955  tyrosyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21660  tyrosyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0207964  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 437 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2388  tyrosyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0169974  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0676  tyrosine--tRNA ligase  47.67 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12330  tyrosyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0366045  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0802  tyrosyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.036725  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01607  tyrosyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2003  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00229572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01597  hypothetical protein  46.92 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1713  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.205571  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1992  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.013475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0714  tyrosyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 419 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000014829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2349  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0752557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1562  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1829  tyrosyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1546  tyrosyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1894  tyrosyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.363334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1725  tyrosyl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00254392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2725  tyrosyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000458338  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3333  tyrosyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1631  tyrosyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 419 aa  363  4e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0855  tyrosyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 426 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00588538  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1694  tyrosyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.239881  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1727  tyrosyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1773  tyrosyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1881  tyrosyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 424 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2554  tyrosyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.268251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2219  tyrosyl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 424 aa  359  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000697542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4556  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4391  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.692977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4407  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4911  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.025731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4776  tyrosyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1811  tyrosyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 424 aa  358  9e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00221389  decreased coverage  0.000321192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4770  tyrosyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.110576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4796  tyrosyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0466  tyrosyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000461262  hitchhiker  0.000000000000286759 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2377  tyrosyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 425 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.898787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4793  tyrosyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00466157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2661  tyrosyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.847771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4488  tyrosyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 418 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3175  tyrosyl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 424 aa  348  7e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0885439  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0263  tyrosyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0033  tyrosyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 420 aa  345  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0921  tyrosyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 423 aa  345  7e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0622234  normal  0.218406 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2069  tyrosyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.309186  normal  0.0187777 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5211  tyrosyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4797  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5215  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5228  tyrosyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 419 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4777  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 419 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4898  tyrosyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 420 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5179  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 419 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.731963 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4936  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 419 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5314  tyrosyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 419 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1819  tyrosyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 420 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1784  tyrosyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 420 aa  342  1e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0431  tyrosyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0825328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1792  tyrosyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2683  tyrosyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 425 aa  335  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0177  tyrosyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 426 aa  335  7.999999999999999e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101088 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1293  tyrosyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 421 aa  334  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01620  tyrosyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 431 aa  335  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0550  tyrosyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 431 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>