32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1251 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1251  ABC transporter permease  100 
 
 		 215 aa  417  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.531282  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2725  exopolysaccharide synthesis, ExoD  38.67 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3669  exopolysaccharide synthesis ExoD  38.24 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.715246  hitchhiker  0.0000593914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0449  exopolysaccharide synthesis, ExoD  35.29 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3324  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.93 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0922  Exopolysaccharide synthesis ExoD  33.14 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.93119e-33 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1256  exopolysaccharide synthesis ExoD  33.66 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0776833  normal  0.796011 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4082  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  88.2  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269354  normal  0.0311141 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4172  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.06 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000786793  normal  0.185707 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3868  molybdate ABC transporter inner membrane protein  30.06 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175484  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01796  Exopolysaccharide synthesis, ExoD  29.52 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0457786  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2718  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.95 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4613  exopolysaccharide synthesis, ExoD  32.37 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4900  exopolysaccharide synthesis ExoD  32.81 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.1432  normal  0.877879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2501  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.52 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00116546  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1428  exopolysaccharide synthesis protein ExoD  24.42 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1368  exopolysaccharide synthesis protein  24.42 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0481317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1981  ABC transporter permease  23.7 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.328917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2346  exopolysaccharide synthesis, ExoD  33.86 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3786  Exopolysaccharide synthesis ExoD  29.41 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.232502  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1096  hypothetical protein  26.09 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4269  exopolysaccharide synthesis ExoD  35.25 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528198  decreased coverage  0.0088823 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1099  hypothetical protein  26.09 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1479  exopolysaccharide synthesis ExoD  36.92 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.438541  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0369  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.71 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2841  Exopolysaccharide synthesis ExoD  24.23 
 
 		 316 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.61734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2728  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.37 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0212409 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2814  exopolysaccharide synthesis, ExoD  30.23 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3473  exopolysaccharide synthesis ExoD  27.06 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4959  exopolysaccharide synthesis ExoD  34.17 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.938152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0150  exopolysaccharide synthesis protein ExoD-related protein  21.99 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1027  Exopolysaccharide synthesis ExoD  28.26 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>