185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0727 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0727  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  667    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0787  pyruvate carboxyltransferase  34.32 
 
 
531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1791  aldolase/synthase, putative  28.7 
 
 
534 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2608  hypothetical protein  29.68 
 
 
295 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2735  hypothetical protein  30.04 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3238  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  27.73 
 
 
353 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2888  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.22 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0536  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  25.51 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2007  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.61 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2668  pyruvate carboxyltransferase  26.23 
 
 
539 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3687  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.81 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1649  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.62 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.264755  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7644  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.85 
 
 
342 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1468  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.85 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2873  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.98 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1619  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  23.19 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3510  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  26.05 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0987  hypothetical protein  27.6 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.861522  normal  0.983085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3072  HMG-CoA lyase-like  25.19 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357205  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1188  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.38 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512459  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0140  pyruvate carboxyltransferase  28.28 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000672144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4743  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.73 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5209  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.21 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28421  normal  0.217725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4391  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.73 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3800  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  24.18 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0681558  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2149  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.54 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1083  pyruvate carboxyltransferase  24.21 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5438  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.63 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113513  normal  0.601738 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5835  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.63 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.633164  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0597  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.08 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2157  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.29 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2882  pyruvate carboxyltransferase  21.9 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5823  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.18 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.821912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1152  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.37 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.296629  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2325  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.09 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4923  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.09 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.854205  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4743  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  21.83 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3254  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  23.87 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0376  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.87 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3273  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.87 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00306  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.87 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0911  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  22.8 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08740  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.41 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00310  hypothetical protein  23.87 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3852  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.01 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15130  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.02 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0427  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.87 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42120  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.02 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0602792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1775  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.79 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0383  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.87 
 
 
337 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0416  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.42 
 
 
337 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0570  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.09 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.739871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3546  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.01 
 
 
340 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0441  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  21.01 
 
 
349 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216235  decreased coverage  0.00115827 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4539  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.62 
 
 
339 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.409121 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2298  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.4 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0890  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.73 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2590  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.73 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2454  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.73 
 
 
347 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13567  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.49 
 
 
346 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000946481 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1984  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.02 
 
 
337 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2258  pyruvate carboxyltransferase  23.19 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5136  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.51 
 
 
349 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.293714  normal  0.0337536 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2094  2-isopropylmalate synthase  24.74 
 
 
509 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2131  2-isopropylmalate synthase  24.74 
 
 
509 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5234  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.09 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.899862  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2410  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.39 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3470  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  21.72 
 
 
344 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0590543  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2079  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.17 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636454  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01666  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.66 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2034  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.76 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1522  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.09 
 
 
352 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1641  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.64 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216253  normal  0.119722 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.03 
 
 
345 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13506  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.58 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0907  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  26.58 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0284448  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2462  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.08 
 
 
342 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.320363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3105  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.64 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0368513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5042  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.69 
 
 
353 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228973  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4081  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.54 
 
 
352 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.389016  decreased coverage  0.000053285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4659  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.69 
 
 
353 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890029  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4747  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.69 
 
 
353 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2534 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2959  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  22.94 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.847372  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2116  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.68 
 
 
340 aa  55.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4224  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  21.69 
 
 
363 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9113  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  20.91 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0238  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  22.31 
 
 
351 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  22.22 
 
 
522 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1765  2-isopropylmalate synthase  21.21 
 
 
460 aa  55.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2573  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  23.9 
 
 
338 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1669  2-isopropylmalate synthase  23.71 
 
 
511 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4617  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.12 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  25.58 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1319  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.06 
 
 
348 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.644156  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  24.56 
 
 
393 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1479  4-hydroxy-2-oxovalerate aldolase  23.79 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  24.38 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3541  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  25.12 
 
 
348 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3801  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  24.39 
 
 
339 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.831034 
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  25.58 
 
 
505 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>