66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2142 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2142  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  100 
 
 		 155 aa  319  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1213  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase and related enzyme  68.83 
 
 		 154 aa  223  7e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0185  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  49.02 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0259  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  43.14 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2403  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5 epimerase  47.06 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.930193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0165  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase related  42.67 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0055  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  37.91 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1887  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  38.82 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394283  normal  0.415914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4813  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  35.81 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.841507  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3931  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  40.15 
 
 		 177 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2887  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  37.33 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2215  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  33.33 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1910  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  35.92 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0875  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  34.39 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1754  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  38.24 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2463  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  38.24 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2861  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  38.03 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000254374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0925  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.540819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1352  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase and related enzymes-like protein  36.72 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2082  hypothetical protein  38.64 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3696  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  32.67 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1258  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  32.47 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1604  dTDP-4-dehydrorhamnose epimerase  28.67 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.679828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2752  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related protein  35.29 
 
 		 176 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.711856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2030  dTDP-4-dehydrorhamnose 3 5-epimerase  32.35 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0540  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  27.81 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2655  hypothetical protein  25.33 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12921  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.197327  hitchhiker  0.00628301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3012  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.1 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.481041  hitchhiker  0.00156221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2560  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.16 
 
 		 182 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1682  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.38 
 
 		 182 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3703  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.11 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.902093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0053  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.25 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0537465  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3237  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.58 
 
 		 181 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.98 
 
 		 364 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3017  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.82 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0514274  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00989  dTDP-4-keto-6-deoxy-D-glucose-3,6-epimerase  28.29 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.48 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1252  hypothetical protein  25.19 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1261  dTDP-4-dehydrorhamnose 35-epimerase related  28.33 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2730  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.03 
 
 		 176 aa  44.3  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.305906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1116  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.82 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0931964  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1448  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  25.95 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0505  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.47 
 
 		 185 aa  43.9  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.035807  normal  0.0162128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2343  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.56 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03171  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.77 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.606681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8195  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1070  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.56 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.921927  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3120  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  31.47 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13113  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  23.97 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.611715  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2660  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.75 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0145  hypothetical protein  32.99 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000131882 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3011  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.57 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.613678 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0996  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.66 
 
 		 201 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3462  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.93 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.616809  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0280  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.85 
 
 		 181 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1382  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  26.62 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.439058  hitchhiker  0.0000218854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1374  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.21 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2506  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.06 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0598  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.08 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.520119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0480  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  30.08 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1244  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.09 
 
 		 182 aa  41.2  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.595096  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0177  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.56 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0246  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  27.56 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0255  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  29.55 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000488402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1123  dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase  28.95 
 
 		 181 aa  40.4  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.295626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>