27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0804 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  31.65 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  31.65 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  31.3 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  30.6 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  34.46 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  30.53 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  27.74 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  27.01 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  27.41 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  27.07 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  25.55 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  27.86 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  25.36 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  26.28 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  25.55 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  24.09 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 		 1363 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  29.63 
 
 		 1048 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.83 
 
 		 1348 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  37.7 
 
 		 413 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  34.43 
 
 		 404 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  40.32 
 
 		 1656 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 1526 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.17 
 
 		 367 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  35.48 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.55 
 
 		 1373 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>