More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3479 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3479  uridylate kinase  100 
 
 		 241 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1510  uridylate kinase  89.17 
 
 		 242 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1294  uridylate kinase  66.95 
 
 		 239 aa  279  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2386  uridylate kinase  66.1 
 
 		 241 aa  279  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1975  uridylate kinase  63.88 
 
 		 230 aa  272  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1036  uridylate kinase, putative  49.36 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.78397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1569  uridylate kinase  49.53 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1003  hypothetical protein  47.53 
 
 		 235 aa  191  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.249631 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1383  uridylate kinase  45.61 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0559412  normal  0.859936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1372  uridylate kinase  45.61 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.138786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0744  uridylate kinase  43.86 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0705972  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1253  uridylate kinase  46.49 
 
 		 225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.262381  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0525  uridylate kinase  45.61 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0788  uridylate kinase  47.34 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.020264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1051  uridylate kinase, putative  40.26 
 
 		 236 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.979226  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1964  uridylate kinase  45 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.082157  normal  0.015373 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1152  uridylate kinase, putative  47.35 
 
 		 223 aa  158  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0760  uridylate kinase, putative  42.36 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.80494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1705  uridylate kinase, putative  37.11 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.118956 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0629  uridylate kinase, putative  31.62 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  35.19 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1191  uridylate kinase  34.09 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1955  uridylate kinase  35.07 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2085  uridylate kinase  29.44 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00820156  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1804  uridylate kinase  33.33 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.513591 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  37.21 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0530  uridylate kinase  32.59 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.390373  normal  0.0202207 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1665  uridylate kinase  34.82 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0833917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0583  uridylate kinase  24.57 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1613  uridylate kinase  31.7 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.52534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  26.97 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04055  uridylate kinase  28.18 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0049  uridylate kinase  31.75 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0787  uridylate kinase  33.33 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  27.05 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1272  uridylate kinase  26.86 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00989068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1103  uridylate kinase  31.18 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.637012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0943  uridylate kinase  29.82 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00384678  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1536  uridylate kinase  32.09 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1345  uridylate kinase  32.09 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3163  uridylate kinase  28.57 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0240  uridylate kinase  30.91 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.432338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0240  uridylate kinase  30.91 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0258  uridylate kinase  30.91 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100769  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0256  uridylate kinase  30.91 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.923917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0243  uridylate kinase  30.91 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  27.6 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1141  uridylate kinase  27.27 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000000922759  normal  0.110772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  26.86 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2546  uridylate kinase  29.71 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0709  uridylate kinase  30.91 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0908162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4080  uridylate kinase  31.55 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217226  normal  0.333914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  28.97 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  25.7 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3788  uridylate kinase  28.44 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180508 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  28.63 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2639  uridylate kinase  27.27 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000176881  normal  0.106095 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2706  uridylate kinase  27.27 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000157467  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2813  uridylate kinase  27.27 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000178948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1631  uridylate kinase  26.86 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2633  uridylate kinase  26.03 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000396495  normal  0.230715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1148  uridylate kinase  31.02 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  29.1 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1677  uridylate kinase  32.23 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1015  uridylate kinase  28.44 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000066823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1068  uridylate kinase  28.44 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0422743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  26.03 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3433  uridylate kinase  27.98 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00014808  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38970  uridylate kinase  33.12 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.765948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0444  uridylate kinase  26.83 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.014483  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3358  uridylate kinase  28.44 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.386876  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  28.22 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00169  uridylate kinase  29.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0505974  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3432  uridylate kinase  29.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0174185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0182  uridylate kinase  29.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0585328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0173  uridylate kinase  29.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.120351  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0181  uridylate kinase  29.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000366692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0164  uridylate kinase  29.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0156878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  33.33 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  26.94 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0175  uridylate kinase  29.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000281467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3489  uridylate kinase  29.7 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.257153  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1593  uridylate kinase  33.12 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.556866  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4184  uridylate kinase  33.12 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1671  uridylate kinase  32.23 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  30.32 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3051  uridylate kinase  32.48 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  25.62 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  25.62 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  25.62 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  25.62 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4437  uridylate kinase  30.43 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000770833 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  31.52 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0686  uridylate kinase  31.25 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013678  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  26.61 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1485  uridylate kinase  29.95 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  28.36 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  28.1 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1696  uridylate kinase  28.69 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0585  uridylate kinase  27.71 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.250613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>